RNA–Protein interactions for RNA: tM(CAU)C

tM(CAU)C, Transcript of Methionine tRNA (tRNA-Met), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tM(CAU)C, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tM(CAU)CtM(CAU)C SAP155P43612 1002 aa16.43■□□□□ 0.22
tM(CAU)CtM(CAU)C RIM15P43565 1770 aa16.43■□□□□ 0.22
tM(CAU)CtM(CAU)C UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
tM(CAU)CtM(CAU)C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data16.39■□□□□ 0.21not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C HPC2Q01448 625 aa16.39■□□□□ 0.21
tM(CAU)CtM(CAU)C MSN5P52918 1224 aa16.38■□□□□ 0.21
tM(CAU)CtM(CAU)C YBP2P53169 641 aa16.37■□□□□ 0.21
tM(CAU)CtM(CAU)C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
tM(CAU)CtM(CAU)C PDS5Q04264 1277 aa16.33■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C HSP104P31539 908 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C NUP145P49687 1317 aa16.31■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C CTT1P06115 562 aa16.31■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C KAR2P16474 682 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C DSD1P53095 428 aa16.31■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C RRD1P40454 393 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C YER156CP40093 338 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C KIN4Q01919 800 aa16.27■□□□□ 0.2
tM(CAU)CtM(CAU)C CWH41P53008 833 aa16.26■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C MHP1P43638 1398 aa16.26■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C RRT14P40470 206 aa16.25■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C CTI6Q08923 506 aa16.25■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C NYV1Q12255 253 aa16.25■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C YKL222CP35995 705 aa16.24■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C ERT1P38140 529 aa16.24■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C CTF4Q01454 927 aa16.24■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C PAP2P53632 584 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C SQS1P53866 767 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
tM(CAU)CtM(CAU)C AKL1P38080 1108 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
tM(CAU)CtM(CAU)C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data16.2■□□□□ 0.18not detected
tM(CAU)CtM(CAU)C TRK1P12685 1235 aa16.16■□□□□ 0.18
tM(CAU)CtM(CAU)C NST1P53935 1240 aa16.16■□□□□ 0.18
tM(CAU)CtM(CAU)C RMT2Q03305 412 aa16.16■□□□□ 0.18
tM(CAU)CtM(CAU)C TEA1P47988 759 aa16.15■□□□□ 0.18
tM(CAU)CtM(CAU)C AOS1Q06624 347 aa16.15■□□□□ 0.18
tM(CAU)CtM(CAU)C POL5P39985 1022 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
tM(CAU)CtM(CAU)C SER1P33330 395 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
tM(CAU)CtM(CAU)C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
tM(CAU)CtM(CAU)C SSA4P22202 642 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
tM(CAU)CtM(CAU)C ALE1Q08548 619 aa16.1■□□□□ 0.17
tM(CAU)CtM(CAU)C LPD1P09624 499 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
tM(CAU)CtM(CAU)C KCC4P25389 1037 aa16.08■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C SMY1P32364 656 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C NTH2P35172 780 aa16.08■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C PFF1P38244 976 aa16.08■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C PEX21P50091 288 aa16.06■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C PHM7Q12252 991 aa16.06■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C YGL082WP53155 381 aa16.04■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C MDG1P53885 366 aa16.04■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C TOP1P04786 769 aa16.02■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C FPK1P53739 893 aa16.02■□□□□ 0.16
tM(CAU)CtM(CAU)C RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C PUS5Q06244 254 aa16■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C CAF20P12962 161 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C SLI15P38283 698 aa15.98■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C RRP46P53256 223 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C ERO1Q03103 563 aa15.98■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C BDF2Q07442 638 aa15.98■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C IRC3Q06683 689 aa15.97■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C SSP2Q08646 371 aa15.96■□□□□ 0.15
tM(CAU)CtM(CAU)C UGA3P26370 528 aa15.93■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C ATG20Q07528 640 aa15.93■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C DCD1P06773 312 aa15.92■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C ARG8P18544 423 aa15.92■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C SIT4P20604 311 aa15.9■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C RET1P22276 1149 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C YKU70P32807 602 aa15.9■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C UTP10P42945 1769 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
tM(CAU)CtM(CAU)C THS1P04801 734 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C APL2P36000 726 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C SHC1P39000 512 aa15.89■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C YNL050CP53952 270 aa15.89■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C NSE3Q05541 303 aa15.89■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C YPR204WQ08995 1032 aa15.85■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C PMD1P32634 1753 aa15.85■□□□□ 0.13
tM(CAU)CtM(CAU)C ZDS2P54786 942 aa15.82■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C GRX6Q12438 231 aa15.82■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C FRD1P32614 470 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C UBP16Q02863 499 aa15.81■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C VPS64Q03944 604 aa15.81■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C RPN1P38764 993 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C YLR278CQ05854 1341 aa15.79■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C PRD1P25375 712 aa15.79■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C RTG2P32608 588 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C HAT1Q12341 374 aa15.79■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C SAS4Q04003 481 aa15.77■□□□□ 0.12
tM(CAU)CtM(CAU)C COQ4O13525 335 aa15.76■□□□□ 0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C YBR287WP38355 427 aa15.76■□□□□ 0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
tM(CAU)CtM(CAU)C TOM1Q03280 3268 aa15.74■□□□□ 0.11
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