RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W ENV9Q08651 330 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W APP1P53933 587 aa5.83□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W TEC1P18412 486 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W EMW1P42842 904 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W TFB3Q03290 321 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W YPR084WQ06821 456 aa5.82□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W CSE4P36012 229 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W YDR444WQ04093 687 aa5.81□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W YBL086CP38177 466 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W RTT106P40161 455 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W PTK2P47116 818 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W PKC1P24583 1151 aa5.8□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W BRL1P38770 471 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W RGA1P39083 1007 aa5.79□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W NAF1P53919 492 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W YBL036CP38197 257 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W SRF1Q12516 437 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W GUT2P32191 649 aa5.78□□□□□ -1.48
YKR078WYKR078W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data5.77□□□□□ -1.49not detected
YKR078WYKR078W NUP85P46673 744 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W YPL062WQ02781 134 aa5.76□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W MKS1P34072 584 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W STE20Q03497 939 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W FRA1Q07825 749 aa5.75□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W ARG82P07250 355 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W LEO1P38439 464 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W AAD14P42884 376 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W OPT2Q06593 877 aa5.74□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W DFG5Q05031 458 aa5.73□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W YLR346CQ06139 101 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W YDL176WQ12027 708 aa5.72□□□□□ -1.49
YKR078WYKR078W BIO2P32451 375 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W ISF1P32488 338 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W FBP26P32604 452 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W EMP47P43555 445 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W MCM16Q12262 181 aa5.71□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W ATG20Q07528 640 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W STE6P12866 1290 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W GLY1P37303 387 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W LSC2P53312 427 aa5.7□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W SUP45P12385 437 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W DLD1P32891 587 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W MRX12P47084 519 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W BDS1Q08347 646 aa5.69□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W MIP1P15801 1254 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W ACO2P39533 789 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W APL6P46682 809 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W YNL108CP53929 270 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W ISU1Q03020 165 aa5.68□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W YJL007CP47080 104 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W YJR098CP47139 656 aa5.67□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W ENO2P00925 437 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W SCW11P53189 542 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W CAF120P53836 1060 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W TY1A-BLQ12266 440 aa5.66□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W UBP2Q01476 1272 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W TCB1Q12466 1186 aa5.65□□□□□ -1.5
YKR078WYKR078W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W YPP1P46951 817 aa5.64□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W BIM1P40013 344 aa5.63□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W HGH1P48362 394 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W HAL5P38970 855 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W ATG32P40458 529 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W YIR007WP40566 764 aa5.62□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W SOH1P38633 127 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W OSH7P38755 437 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W RIM21P48565 533 aa5.61□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W WTM2Q12206 467 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W ATG3P40344 310 aa5.6□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W TIF1P10081 395 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W DAT1P13483 248 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W RDS2P19541 446 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W UTR2P32623 467 aa5.59□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W DLD3P39976 496 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
YKR078WYKR078W MRX10Q05648 414 aa5.58□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W DAL1P32375 460 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W RTG2P32608 588 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W VTC4P47075 721 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W TY1A-MR1Q04215 440 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W HDA3Q06623 655 aa5.57□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W CDC19P00549 500 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W ENO1P00924 437 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W ROG3P43602 733 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W DMA2P53924 522 aa5.56□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W TBS1P38114 1094 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W SSN3P39073 555 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W SLX8P40072 274 aa5.55□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W CCP1P00431 361 aa5.54□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data5.54□□□□□ -1.52not detected
YKR078WYKR078W UTP7P40055 554 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W HPF1Q05164 967 aa5.53□□□□□ -1.52
YKR078WYKR078W MSN5P52918 1224 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.2 ms