RNA–Protein interactions for RNA: YGL197W

MDS3, Transcript of Putative component of the TOR regulatory pathway, yeast

Gene MDS3, Length 4,464 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDS3	YGL197W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-JR2	P47099	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	RGA2	Q06407	1009 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	MMP1	Q12372	583 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	SDH2	P21801	266 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	YPP1	P46951	817 aa		2.72	□□□□□ -1.97
MDS3	YGL197W	UBP2	Q01476	1272 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	PEP1	P32319	1579 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	ATG2	P53855	1592 aa		2.71	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	UGA3	P26370	528 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	KIP2	P28743	706 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	LSC2	P53312	427 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	IXR1	P33417	597 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	ASH1	P34233	588 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	LYS5	P50113	272 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	TUB4	P53378	473 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	YDR444W	Q04093	687 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	KEX2	P13134	814 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	SSK2	P53599	1579 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	CST6	P40535	587 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	VTC4	P47075	721 aa		2.7	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	SLY41	P22215	453 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	MLP2	P40457	1679 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	ESP1	Q03018	1630 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	SEC2	P17065	759 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	FPK1	P53739	893 aa		2.69	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	MET22	P32179	357 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	ACO2	P39533	789 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	AGE1	Q04412	482 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	PHM7	Q12252	991 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	SCW11	P53189	542 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	MIP1	P15801	1254 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	HPC2	Q01448	625 aa		2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	GUT2	P32191	649 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	VAC17	P25591	423 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	MTC5	Q03897	1148 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	NIS1	P53939	407 aa		2.67	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	HSL1	P34244	1518 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	YBT1	P32386	1661 aa		2.66	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	SIS2	P36024	562 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	YFL034W	P43564	1073 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	YJR115W	P47152	169 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	YGR035C	P53222	116 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	MET32	Q12041	191 aa		2.65	□□□□□ -1.98
MDS3	YGL197W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	YBL086C	P38177	466 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	YDL206W	Q12424	762 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	CHD1	P32657	1468 aa		2.65	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	TEC1	P18412	486 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	CSN12	P47130	423 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	BRL1	P38770	471 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	AAD14	P42884	376 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	INO80	P53115	1489 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	DIT2	P21595	489 aa		2.64	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	HIR3	P47171	1648 aa		2.63	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	ULS1	Q08562	1619 aa		2.63	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	SCT1	P32784	759 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	BDS1	Q08347	646 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	TRK2	P28584	889 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	MKS1	P34072	584 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	TBS1	P38114	1094 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	STE6	P12866	1290 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	FBP26	P32604	452 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	RSC30	P38781	883 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	SSN2	P38931	1420 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	MSN5	P52918	1224 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	DAL1	P32375	460 aa		2.61	□□□□□ -1.99
MDS3	YGL197W	UBP15	P50101	1230 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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