RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SPO19	Q03029	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	TLG2	Q08144	397 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SRS2	P12954	1174 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SRB4	P32569	687 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PEX5	P35056	612 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CSE4	P36012	229 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PAN1	P32521	1480 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	HIF1	Q12373	385 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	UFD2	P54860	961 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	MSH1	P25846	959 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CIR1	P42940	261 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RSC1	P53236	928 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RAD50	P12753	1312 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CYC8	P14922	966 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CSC1	Q06538	782 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CDC34	P14682	295 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PUP2	P32379	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	YOL098C	Q12496	1037 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	YNL144C	P53907	740 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	INO80	P53115	1489 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	MRC1	P25588	1096 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	NFU1	P32860	256 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	OSH2	Q12451	1283 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	STH1	P32597	1359 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	BUD4	P47136	1447 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	ACF4	P47129	309 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	BRO1	P48582	844 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SPC42	P36094	363 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	ZIP1	P31111	875 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PBY1	P38254	753 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SWH1	P35845	1188 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PEX15	Q08215	383 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	IOC4	Q04213	475 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	CSM3	Q04659	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	ADY3	Q07732	790 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	SEC20	P28791	383 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	RTT105	P40063	208 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TOM1	YDR457W	TPD3	P31383	635 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	BEM4	P39011	633 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SPC72	P39723	622 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	STU2	P46675	888 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ENT3	P47160	408 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SWC3	P31376	625 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	LCD1	Q04377	747 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	CGR1	P53188	120 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	COG6	P53959	839 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	RMD1	Q03441	430 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	VPS64	Q03944	604 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ACE2	P21192	770 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	PDR18	P53756	1333 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SEC2	P17065	759 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ATG17	Q06410	417 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SPO21	Q12411	609 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SPO16	P17122	198 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	UGA3	P26370	528 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	YKE2	P52553	114 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SWI1	P09547	1314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	GLG2	P47011	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ZRT2	Q12436	422 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	BYE1	P36106	594 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	YPL191C	Q08930	360 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	ATG13	Q06628	738 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	CLN2	P20438	545 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	TFC1	P32367	649 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	SAP185	P40856	1058 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TOM1	YDR457W	COS5	P47187	383 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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