RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-2

RDN25-2, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-2, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-2RDN25-2 ITT1Q04638 464 aa11.39□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 PDI1P17967 522 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 MSP1P28737 362 aa11.38□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 TRM3Q07527 1436 aa11.37□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data11.36□□□□□ -0.59not detected
RDN25-2RDN25-2 MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 NOT3P06102 836 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 NNF2P53253 936 aa11.35□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 LEU2P04173 364 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 CLB1P24868 471 aa11.34□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 RPN7Q06103 429 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RDN25-2RDN25-2 TPM2P40414 161 aa11.33□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 RRT14P40470 206 aa11.33□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 AUS1Q08409 1394 aa11.33□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 RIM101P33400 625 aa11.32□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 RFC1P38630 861 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 MED8P38304 223 aa11.32□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 ITC1P53125 1264 aa11.32□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 TEA1P47988 759 aa11.31□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 ECM1P39715 212 aa11.31□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 SPO1P53541 631 aa11.31□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 MDG1P53885 366 aa11.31□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 TAP42Q04372 366 aa11.31□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 UTP13Q05946 817 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 HSP82P02829 709 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 DPS1P04802 557 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 RTF1P53064 558 aa11.3□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 NKP2Q06162 153 aa11.3□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 HAP1P0CE41 1502 aa11.3□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 SRS2P12954 1174 aa11.28□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 DEP1P31385 405 aa11.28□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 RSC1P53236 928 aa11.28□□□□□ -0.6
RDN25-2RDN25-2 RPN1P38764 993 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 PIL1P53252 339 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 YGR122WP53272 402 aa11.27□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 BRN1P38170 754 aa11.26□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 YNG2P38806 282 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 VPS4P52917 437 aa11.26□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 DSD1P53095 428 aa11.26□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 CSI1Q04368 295 aa11.26□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 DLD1P32891 587 aa11.26□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 LTV1P34078 463 aa11.25□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 AKL1P38080 1108 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 CPS1P27614 576 aa11.25□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 HXT13P39924 564 aa11.24□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 GRX4P32642 244 aa11.24□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 SRT1Q03175 343 aa11.24□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 HXT17P53631 564 aa11.23□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 PSK1P31374 1356 aa11.22□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 MTR4P47047 1073 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 GYP7P48365 746 aa11.22□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 ESC2Q06340 456 aa11.22□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 NPA3P47122 385 aa11.21□□□□□ -0.61
RDN25-2RDN25-2 MCM2P29469 868 aa11.2□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 ZDS1P50111 915 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 EDE1P34216 1381 aa11.2□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 NUP145P49687 1317 aa11.2□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 VPS20Q04272 221 aa11.2□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 GDT1P38301 280 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 RMD1Q03441 430 aa11.19□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 LSP1Q12230 341 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 PSE1P32337 1089 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 RAD50P12753 1312 aa11.19□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 SWC3P31376 625 aa11.19□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 SIR4P11978 1358 aa11.18□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 NOP14Q99207 810 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 MFT1P33441 392 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 SAP190P36123 1033 aa11.17□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 GCR2Q01722 534 aa11.17□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 VPS60Q03390 229 aa11.17□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 HSP104P31539 908 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 DSF2P38213 736 aa11.16□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 COG8Q04632 607 aa11.16□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 BDP1P46678 594 aa11.16□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 HOS3Q02959 697 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 LCD1Q04377 747 aa11.16□□□□□ -0.62
RDN25-2RDN25-2 RRP14P36080 434 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 ARP5P53946 755 aa11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 RPO41P13433 1351 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 VAS1P07806 1104 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data11.14□□□□□ -0.63not detected
RDN25-2RDN25-2 YGL140CP53120 1219 aa11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 YNR029CP53729 429 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 UBP10P53874 792 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 SFI1Q12369 946 aa11.14□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 PLP2Q12017 286 aa11.13□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 RAD24P32641 659 aa11.13□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 MGA2P40578 1113 aa11.13□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 NTH2P35172 780 aa11.13□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 COQ4O13525 335 aa11.12□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 DID4P36108 232 aa11.12□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 PUP2P32379 260 aa11.12□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 CIN4P39110 191 aa11.12□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 YNL050CP53952 270 aa11.12□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
RDN25-2RDN25-2 YMR102CQ03177 834 aa11.11□□□□□ -0.63
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