RNA–Protein interactions for RNA: YKL125W

RRN3, Transcript of Protein required for transcription of rDNA by RNA polymerase I, yeastyeast

Gene RRN3, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN3YKL125W REG1Q00816 1014 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ECM9Q02202 377 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W MRPS17Q03246 237 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W GIM5Q04493 163 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W TVP18Q04767 167 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W TFC6Q06339 672 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W HOS1Q12214 470 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RKM5Q12367 367 aa5.05□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SPO7P18410 259 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PPZ1P26570 692 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W COQ3P27680 312 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W FMO1P38866 432 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W FET3P38993 636 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data5.04□□□□□ -1.6not detected
RRN3YKL125W RPL10P41805 221 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W LOH1P47055 219 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YDL183CP48569 320 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PKP2P53170 491 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W TNA1P53322 534 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ODC1Q03028 310 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W LDB18Q07887 179 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W IZH3Q07959 543 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YOL159CQ08300 171 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W NMD4Q12129 218 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YLL058WQ12198 575 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W VAM3Q12241 283 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YOP1Q12402 180 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PCD1Q12524 340 aa5.04□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W NAR1P23503 491 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ERG9P29704 444 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6not detected
RRN3YKL125W TFA2P36145 328 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W NOP4P37838 685 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PRS3P38689 320 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PEX28P38848 579 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W CYC2P38909 366 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PAN6P40459 309 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W HIS6P40545 261 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PHO86P46956 311 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W AIM22P47051 409 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YJR154WP47181 346 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ASK10P48361 1146 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W TYW3P53177 273 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YNR040WP53736 256 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W BRE5P53741 515 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SLM2P53955 656 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SPR6Q01684 191 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YDR248CQ03786 193 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W HSP31Q04432 237 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W NEJ1Q06148 342 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SYT1Q06836 1226 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SSK1Q07084 712 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SRF1Q12516 437 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YPR145C-AQ2V2P0 78 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W Q0142Q9ZZW4 58 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W FKS3Q04952 1785 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RAS1P01119 309 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W AI1P03875 834 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SEC12P11655 471 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YCL002CP25565 263 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6not detected
RRN3YKL125W YKR075CP36155 307 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W MBA1P38300 278 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W EFM1P38732 585 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W PPE1P38796 400 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W TMA108P40462 946 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YIL108WP40483 696 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W CIT3P43635 486 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W AAD10P47182 288 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W HLJ1P48353 224 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YGR168CP53293 376 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W KTR6P54070 446 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data5.03□□□□□ -1.6not detected
RRN3YKL125W SNO1Q03144 224 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YPR127WQ06494 345 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ASR1Q06834 288 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W MFG1Q07684 458 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W ENT4Q07872 247 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RAD28Q12021 506 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YDL176WQ12027 708 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W YLR126CQ12288 251 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W RGS2Q99188 309 aa5.03□□□□□ -1.6
RRN3YKL125W GUK1P15454 187 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W EST1P17214 699 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W FUN14P18411 198 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W GRR1P24814 1151 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data5.02□□□□□ -1.61not detected
RRN3YKL125W PEX4P29340 183 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W SPS19P32573 292 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W YPT7P32939 208 aa5.02□□□□□ -1.61
RRN3YKL125W RMA1P36001 430 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
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