Protein–RNA interactions for Protein: Q04767

TVP18, Golgi apparatus membrane protein TVP18, yeastyeast

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP18Q04767 NSR1YGR159C 1245 nt15.17■□□□□ 0.02
TVP18Q04767 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.86□□□□□ -0.03
TVP18Q04767 NOP1YDL014W 984 nt14.39□□□□□ -0.11
TVP18Q04767 MDJ1YFL016C 1536 nt13.69□□□□□ -0.22
TVP18Q04767 SSA3YBL075C 1950 nt13.14□□□□□ -0.31
TVP18Q04767 YKL036CYKL036C 393 nt12.88□□□□□ -0.35
TVP18Q04767 YJL027CYJL027C 417 nt12.7□□□□□ -0.38
TVP18Q04767 SRX1YKL086W 384 nt12.53□□□□□ -0.4
TVP18Q04767 Q0297Q0297 156 nt12.44□□□□□ -0.42
TVP18Q04767 DBP2YNL112W 1641 nt11.98□□□□□ -0.49
TVP18Q04767 YBR190WYBR190W 312 nt11.88□□□□□ -0.51
TVP18Q04767 YCR051WYCR051W 669 nt11.82□□□□□ -0.52
TVP18Q04767 RTC3YHR087W 336 nt11.56□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.53□□□□□ -0.56
TVP18Q04767 SCS3YGL126W 1143 nt11.47□□□□□ -0.57
TVP18Q04767 CCC1YLR220W 969 nt11.35□□□□□ -0.59
TVP18Q04767 RVS167YDR388W 1449 nt11.31□□□□□ -0.6
TVP18Q04767 PUT4YOR348C 1884 nt11.27□□□□□ -0.6
TVP18Q04767 SSA4YER103W 1929 nt11.22□□□□□ -0.61
TVP18Q04767 PAC11YDR488C 1602 nt11.17□□□□□ -0.62
TVP18Q04767 RPP1BYDL130W 321 nt11.15□□□□□ -0.62
TVP18Q04767 YOL085CYOL085C 342 nt11.13□□□□□ -0.63
TVP18Q04767 NVJ2YPR091C 2313 nt11.05□□□□□ -0.64
TVP18Q04767 SPT5YML010W 3192 nt11.03□□□□□ -0.64
TVP18Q04767 SCJ1YMR214W 1134 nt11.02□□□□□ -0.65
TVP18Q04767 PKP1YIL042C 1185 nt10.94□□□□□ -0.66
TVP18Q04767 BDF1YLR399C 2061 nt10.88□□□□□ -0.67
TVP18Q04767 POA1YBR022W 534 nt10.83□□□□□ -0.68
TVP18Q04767 FPS1YLL043W 2010 nt10.82□□□□□ -0.68
TVP18Q04767 BSC6YOL137W 1494 nt10.82□□□□□ -0.68
TVP18Q04767 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.78□□□□□ -0.68
TVP18Q04767 SHR5YOL110W 714 nt10.78□□□□□ -0.68
TVP18Q04767 ARE1YCR048W 1833 nt10.74□□□□□ -0.69
TVP18Q04767 TAT1YBR069C 1860 nt10.74□□□□□ -0.69
TVP18Q04767 URN1YPR152C 1398 nt10.66□□□□□ -0.7
TVP18Q04767 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.66□□□□□ -0.7
TVP18Q04767 PET122YER153C 765 nt10.64□□□□□ -0.71
TVP18Q04767 OPI9YLR338W 858 nt10.62□□□□□ -0.71
TVP18Q04767 SAH1YER043C 1350 nt10.59□□□□□ -0.71
TVP18Q04767 RPN10YHR200W 807 nt10.53□□□□□ -0.72
TVP18Q04767 SCR1SCR1 522 nt10.52□□□□□ -0.73
TVP18Q04767 DEP1YAL013W 1218 nt10.5□□□□□ -0.73
TVP18Q04767 YDJ1YNL064C 1230 nt10.48□□□□□ -0.73
TVP18Q04767 SSA1YAL005C 1929 nt10.45□□□□□ -0.74
TVP18Q04767 YNL208WYNL208W 600 nt10.4□□□□□ -0.74
TVP18Q04767 PUN1YLR414C 792 nt10.35□□□□□ -0.75
TVP18Q04767 BUD23YCR047C 828 nt10.33□□□□□ -0.76
TVP18Q04767 RRN5YLR141W 1092 nt10.31□□□□□ -0.76
TVP18Q04767 MEP2YNL142W 1500 nt10.27□□□□□ -0.77
TVP18Q04767 GAR1YHR089C 618 nt10.23□□□□□ -0.77
TVP18Q04767 PTC2YER089C 1395 nt10.22□□□□□ -0.77
TVP18Q04767 UME6YDR207C 2511 nt10.2□□□□□ -0.78
TVP18Q04767 NAB2YGL122C 1578 nt10.19□□□□□ -0.78
TVP18Q04767 ATS1YAL020C 1002 nt10.18□□□□□ -0.78
TVP18Q04767 YJR018WYJR018W 363 nt10.18□□□□□ -0.78
TVP18Q04767 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.1□□□□□ -0.79
TVP18Q04767 YBR220CYBR220C 1683 nt10.06□□□□□ -0.8
TVP18Q04767 DCW1YKL046C 1350 nt10.04□□□□□ -0.8
TVP18Q04767 PCH2YBR186W 1695 nt10.01□□□□□ -0.81
TVP18Q04767 YMR090WYMR090W 684 nt9.99□□□□□ -0.81
TVP18Q04767 RSB1YOR049C 1065 nt9.99□□□□□ -0.81
TVP18Q04767 GUT2YIL155C 1950 nt9.98□□□□□ -0.81
TVP18Q04767 DAL1YIR027C 1383 nt9.98□□□□□ -0.81
TVP18Q04767 FIS1YIL065C 468 nt9.94□□□□□ -0.82
TVP18Q04767 RPP2BYDR382W 333 nt9.93□□□□□ -0.82
TVP18Q04767 TIR1YER011W 765 nt9.93□□□□□ -0.82
TVP18Q04767 INM2YDR287W 879 nt9.92□□□□□ -0.82
TVP18Q04767 SEC11YIR022W 504 nt9.92□□□□□ -0.82
TVP18Q04767 EMI2YDR516C 1503 nt9.91□□□□□ -0.82
TVP18Q04767 YJL225CYJL225C 5277 nt9.88□□□□□ -0.83
TVP18Q04767 FPR4YLR449W 1179 nt9.88□□□□□ -0.83
TVP18Q04767 BOR1YNL275W 1731 nt9.85□□□□□ -0.83
TVP18Q04767 PHO4YFR034C 939 nt9.85□□□□□ -0.83
TVP18Q04767 YJR120WYJR120W 351 nt9.85□□□□□ -0.83
TVP18Q04767 SDH1YKL148C 1923 nt9.83□□□□□ -0.84
TVP18Q04767 YPS1YLR120C 1710 nt9.8□□□□□ -0.84
TVP18Q04767 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.76□□□□□ -0.85
TVP18Q04767 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.76□□□□□ -0.85
TVP18Q04767 YDL221WYDL221W 552 nt9.75□□□□□ -0.85
TVP18Q04767 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.74□□□□□ -0.85
TVP18Q04767 PIB2YGL023C 1908 nt9.74□□□□□ -0.85
TVP18Q04767 MCH5YOR306C 1566 nt9.72□□□□□ -0.85
TVP18Q04767 YBL100CYBL100C 315 nt9.71□□□□□ -0.86
TVP18Q04767 YDR095CYDR095C 411 nt9.68□□□□□ -0.86
TVP18Q04767 RTF1YGL244W 1677 nt9.65□□□□□ -0.86
TVP18Q04767 BDH2YAL061W 1254 nt9.63□□□□□ -0.87
TVP18Q04767 SCC4YER147C 1875 nt9.61□□□□□ -0.87
TVP18Q04767 FUN26YAL022C 1554 nt9.58□□□□□ -0.88
TVP18Q04767 ALF1YNL148C 765 nt9.55□□□□□ -0.88
TVP18Q04767 TRM9YML014W 840 nt9.53□□□□□ -0.88
TVP18Q04767 YSC84YHR016C 1407 nt9.52□□□□□ -0.89
TVP18Q04767 RPP2AYOL039W 321 nt9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms