RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	JAC1	P53193	184 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SWC4	P53201	476 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NCE103	P53615	221 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNL033W	P53964	284 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YNL019C	P53975	284 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ECM9	Q02202	377 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PRM15	Q03262	622 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TPP1	Q03796	238 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RUB1	Q03919	77 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SND1	Q04007	877 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YDR387C	Q04162	555 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BCH1	Q05029	724 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ADY4	Q05955	493 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TDA6	Q06466	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GPN3	Q06543	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DSE3	Q08729	430 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPL199C	Q08954	240 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPQ1	Q12010	308 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SVS1	Q12254	260 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RBD2	Q12270	262 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MHF1	Q3E835	90 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AFI1	Q99222	893 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TRP3	P00937	484 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SLY1	P22213	666 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CDC50	P25656	391 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MCM10	P32354	571 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DPH2	P32461	534 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SEF1	P34228	1148 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MRPL15	P36523	253 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MBA1	P38300	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SUL1	P38359	859 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PHO89	P38361	574 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LAG1	P38703	411 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IKI1	P38874	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NVJ1	P38881	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AIM18	P38884	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SAW1	P39735	261 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AVT2	P39981	480 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YER010C	P40011	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RGI2	P40188	164 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PGD1	P40356	397 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	GTO1	P48239	356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RTA1	P53047	317 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	COS12	P53053	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BUD9	P53226	547 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CBK1	P53894	756 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ARP4	P80428	489 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YPL071C	Q02864	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YMD8	Q03697	442 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PPN1	Q04119	674 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	VID22	Q05934	901 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BSP1	Q06604	576 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	FRE3	Q08905	711 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DDC1	Q08949	612 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HFI1	Q12060	488 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	DIN7	Q12086	430 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RIB3	Q99258	208 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ISN1	Q99312	450 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AI3	P03877	415 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SCEI	P03882	235 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	KIN28	P06242	306 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SPT3	P06844	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	CHS1	P08004	1131 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	SPS4	P09937	338 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	YER152C	P10356	443 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	HOM3	P10869	527 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IFM1	P25038	676 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	POF1	P25576	258 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	LDS1	P31379	325 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PHA2	P32452	334 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ATP11	P32453	318 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	TMT1	P32643	299 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	BEM3	P32873	1128 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	ZRT3	P34240	503 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	PTC1	P35182	281 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	KAE1	P36132	386 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	APT2	P36973	181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	MAL32	P38158	584 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	AVT5	P38176	459 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SOD1	YJR104C	IST2	P38250	946 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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