RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W DCI1Q08558 271 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W GPM3Q12326 303 aa3.4□□□□□ -1.87
SPT15YER148W NFT1P0CE68 1218 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W REV1P12689 985 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YCL068CP25593 260 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CYS4P32582 507 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PEX5P35056 612 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YBR056WP38081 501 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SHE10P53075 577 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RSC1P53236 928 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W STD1Q02794 444 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W NSE1Q07913 336 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CEX1Q12453 761 aa3.39□□□□□ -1.87
SPT15YER148W POP5P28005 173 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YEL045CP32616 141 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CHK1P38147 527 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W FAD1P38913 306 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W TVP23P38962 199 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MMF1P40185 145 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SIM1P40472 476 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MOB1P40484 314 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SDT1P53078 280 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W GYL1Q04322 720 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W NDL1Q06568 189 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W NDE2Q07500 545 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W HRT3Q12347 344 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W ERP3Q12403 225 aa3.38□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CLN3P13365 580 aa3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W ALG1P16661 449 aa3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W LDB16P25587 256 aa3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YKL097CP34245 136 aa3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SWD3P38123 315 aa3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W INM1P38710 295 aa3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PRE5P40302 234 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SPT15YER148W ADH2P00331 348 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W DST1P07273 309 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PHA2P32452 334 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SPR1P32603 445 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W DBP7P36120 742 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YER079WP40052 210 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CHS6P40955 746 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W TOS3P43637 560 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MDE1P47095 244 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PEX25Q02969 394 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MDM36Q06820 579 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W IRC25Q07951 179 aa3.36□□□□□ -1.87
SPT15YER148W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CDC21P06785 304 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SLX1P38324 304 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W STP2P38704 541 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W GPI16P38875 610 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W COX14P39103 70 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YJL055WP47044 245 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PIB2P53191 635 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MTQ1P53944 314 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W CCE1Q03702 353 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YMR321CQ04898 105 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W INM2Q05533 292 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YRM1Q12340 786 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W NCA2Q12374 616 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MSB2P32334 1306 aa3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MAS2P11914 482 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RVS161P25343 265 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W SBE22P38814 852 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YIL029CP40538 142 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W LCB2P40970 561 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YDR541CQ03049 344 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W YMR027WQ04371 470 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MHR1Q06630 226 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W RBD2Q12270 262 aa3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SPT15YER148W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88 RIP-Chip
SPT15YER148W PDE2P06776 526 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W EXG1P23776 448 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PHO91P27514 894 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
SPT15YER148W SKN1P33336 771 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W PAC11P40960 533 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W NUP116Q02630 1113 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W SPH1Q06160 661 aa3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SPT15YER148W HSP82P02829 709 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SPT15YER148W ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms