RNA–Protein interactions for RNA: YCL043C

PDI1, Transcript of Protein disulfide isomerase, yeast

Gene PDI1, Length 1,569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDI1	YCL043C	MNT2	P53059	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	EMC4	P53073	190 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PEF1	P53238	335 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YGR067C	P53243	804 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	FRE4	P53746	719 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GRX5	Q02784	150 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TMN2	Q04562	672 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ARR2	Q06597	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	RSC58	Q07979	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	IRC10	Q08118	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	FRE5	Q08908	694 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	ALG7	P07286	448 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
PDI1	YCL043C	OCA4	P25366	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	LST4	P34239	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SEA4	P38164	1038 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TIM17	P39515	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GTT1	P40582	234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	IME4	P41833	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	TIS11	P47977	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	KXD1	P53158	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	FMP48	P53233	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YNL181W	P53878	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MPS1	P54199	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YML131W	Q03102	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	PRM15	Q03262	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	BUR2	Q05949	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MFG1	Q07684	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	THP1	Q08231	455 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	GPB1	Q08886	897 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	MLH3	Q12083	715 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	UBR1	P19812	1950 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PDI1	YCL043C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PHO5	P00635	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	REP2	P03872	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ATP4	P05626	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CDC4	P07834	779 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BAR1	P12630	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RNP1	P32385	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	STE14	P32584	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	MTC2	P34246	357 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TAT1	P38085	619 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	CDS1	P38221	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	RCK1	P38622	512 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SSO2	P39926	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BUR6	P40096	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SWM2	P40342	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AAD14	P42884	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	GAT1	P43574	510 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TOM22	P49334	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	NBP35	P52920	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HHO1	P53551	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YDR541C	Q03049	344 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YMD8	Q03697	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	FRE3	Q08905	711 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ENV7	Q12003	364 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TRM8	Q12009	286 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	AEP3	Q12089	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	TIM9	O74700	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SPT3	P06844	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SPS2	P08459	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	PET54	P10834	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ARE1	P25628	610 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	ERG9	P29704	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	HXT5	P38695	592 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	SBE22	P38814	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDI1	YCL043C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	RIP-Chip

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