RNA–Protein interactions for RNA: YJL094C

KHA1, Transcript of Putative K+/H+ antiporter, yeast

Gene KHA1, Length 2,622 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KHA1	YJL094C	URC2	Q04411	772 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YLL056C	Q12177	298 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SPO24	Q3E752	67 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	NUP192	P47054	1683 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YCR007C	P25354	239 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	VPS45	P38932	577 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ALP1	P38971	573 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YAL037W	P39728	267 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YIP1	P53039	248 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YGL185C	P53100	379 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ESBP6	P53918	673 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	TAF12	Q03761	539 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	THI20	Q08224	551 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ORT1	Q12375	292 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RMD5	Q12508	421 aa		2.76	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RPL12B	P0CX54	165 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	MAS1	P10507	462 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	MGR1	P25573	417 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ACH1	P32316	526 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RTT102	P53330	157 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SAM50	P53969	484 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	MPS1	P54199	764 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	MSS11	Q03825	758 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	URH1	Q04179	340 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YLR297W	Q05899	129 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	BNA5	Q05979	453 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RRT8	Q08219	342 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	BUG1	Q12191	341 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	FRE2	P36033	711 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SPC34	P36131	295 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	END3	P39013	349 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YIL024C	P40543	189 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	NUP53	Q03790	475 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ARR1	Q06596	294 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	PNS1	Q12412	539 aa		2.75	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SPO12	P17123	173 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SKN1	P33336	771 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ECM15	P35195	104 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SWC5	P38326	303 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SNL1	P40548	159 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YHC3	P47040	408 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RAD17	P48581	401 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	BRO1	P48582	844 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	FRE4	P53746	719 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	CAB5	Q03941	241 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	AIM33	Q04516	312 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RNH1	Q04740	348 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ASA1	Q06822	443 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ITR1	P30605	584 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YPK3	P38070	525 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	CSM2	P40465	213 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	GCD10	P41814	478 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YGL114W	P53134	725 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ARK1	P53974	638 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SYO1	Q07395	620 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RUP1	Q12242	671 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ATG34	Q12292	412 aa		2.74	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	PET123	P17558	318 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	PET18	P25362	215 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YUH1	P35127	236 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SCO2	P38072	301 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
KHA1	YJL094C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SPG5	P42933	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SNO3	P43544	222 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	AGX1	P43567	385 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YGR266W	P53326	701 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	RRN5	Q02983	363 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	PLP2	Q12017	286 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	CRC1	Q12289	327 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	ARP6	Q12509	438 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YCR022C	P25620	114 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	MSK1	P32048	576 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YNL146W	P53906	100 aa		2.73	□□□□□ -1.97
KHA1	YJL094C	YLH47	Q06493	454 aa		2.73	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.9 ms