RNA–Protein interactions for RNA: YGR089W

NNF2, Transcript of Protein that exhibits physical and genetic interactions with Rpb8p, yeast

Gene NNF2, Length 2,811 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNF2	YGR089W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	VTA1	Q06263	330 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RFM1	Q12192	310 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MED1	Q12321	566 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PRM7	Q12459	698 aa		0.51	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	IMA3	P0CW40	589 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	IMA4	P0CW41	589 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CKA1	P15790	372 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CDC50	P25656	391 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YHK8	P38776	514 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	IRC6	P43615	237 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	LCB3	P47013	409 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	FLC3	P53121	802 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	COS1	P53822	381 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TDA1	Q03533	586 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CCE1	Q03702	353 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PIN3	Q06449	215 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MDM36	Q06820	579 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	IMA2	Q08295	589 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YRF1-2	P40105	1681 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DPH2	P32461	534 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SAS3	P34218	831 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DTR1	P38125	572 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	COS5	P47187	383 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YGL262W	P53054	175 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	URH1	Q04179	340 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	AIM32	Q04689	311 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	COS7	Q07788	383 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ATG34	Q12292	412 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	HSP42	Q12329	375 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.5	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MMS1	Q06211	1407 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CAP2	P13517	287 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ERG3	P32353	365 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YME2	P32843	850 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YBR056W	P38081	501 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRN10	P38204	145 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	GPI18	P38211	433 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	AIM24	P47127	394 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YGL138C	P53122	345 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	HST1	P53685	503 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YMR102C	Q03177	834 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	HOT1	Q03213	719 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RRI2	Q12348	645 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RTN2	Q12443	393 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	RAX2	Q12465	1220 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ISN1	Q99312	450 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PDR10	P51533	1564 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	COX3	P00420	269 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MRP7	P12687	371 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ZRC1	P20107	442 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TFB1	P32776	642 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	STP2	P38704	541 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	PFS1	P38872	237 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	HAC1	P41546	238 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	IGD1	P43598	195 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SKO1	Q02100	647 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	SMC5	Q08204	1093 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	EAF3	Q12432	401 aa		0.49	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CLC1	P17891	233 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	FMT1	P32785	401 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	ECT1	P33412	323 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MAM33	P40513	266 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YPS6	P40583	537 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TOS3	P43637	560 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	YIP5	P53108	310 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	CLD1	P53264	445 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	MRPL19	P53875	158 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	OCA2	P53949	197 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	STD1	Q02794	444 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	TAF11	Q04226	346 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	COG4	Q06096	861 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	BUG1	Q12191	341 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	NCA2	Q12374	616 aa		0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
NNF2	YGR089W	DNF3	Q12674	1656 aa		0.48	□□□□□ -2.33

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