RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W COX3P00420 269 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W PDE2P06776 526 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W CDC21P06785 304 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W DST1P07273 309 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W KAR9P32526 644 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W FAD1P38913 306 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W TIS11P47977 285 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W VPS9P54787 451 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W NUP116Q02630 1113 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W GYL1Q04322 720 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YMR027WQ04371 470 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YLR456WQ06199 204 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W GPM3Q12326 303 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W WTM1Q12363 437 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ERP4Q12450 207 aa2.8□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W STN1P38960 494 aa2.79□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W TOS3P43637 560 aa2.79□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ADA2Q02336 434 aa2.79□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W UAF30Q08747 228 aa2.79□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W NCA2Q12374 616 aa2.79□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W PEX5P35056 612 aa2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W INM1P38710 295 aa2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W MMF1P40185 145 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YJL055WP47044 245 aa2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W FDH1Q08911 376 aa2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W RBD2Q12270 262 aa2.78□□□□□ -1.96
NSE4YDL105W ATP1P07251 545 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W ALG1P16661 449 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W COX13P32799 129 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SKN1P33336 771 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MRPL10P36520 322 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SBE22P38814 852 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MAM33P40513 266 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MRM2P53123 320 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RSC1P53236 928 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SHY1P53266 389 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MDM36Q06820 579 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W NSE1Q07913 336 aa2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W CAP2P13517 287 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W EXG1P23776 448 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PHO91P27514 894 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PHA2P32452 334 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W CSE2P33308 149 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SIM1P40472 476 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W LOT6Q07923 191 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W JID1Q12350 301 aa2.76□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SLM5P25345 492 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data2.75□□□□□ -1.97not detected
NSE4YDL105W AIM10P39965 576 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W LCB2P40970 561 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W HAC1P41546 238 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YFR057WP43625 151 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W AIM24P47127 394 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SPR6Q01684 191 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YMR102CQ03177 834 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SMC5Q08204 1093 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W EAF3Q12432 401 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W IZH2Q12442 317 aa2.75□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W POM152P39685 1337 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PIS1P06197 220 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MSI1P13712 422 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RPB5P20434 215 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W MNE1P24720 663 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PRR1P28708 518 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W SKT5P34226 696 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W LRP1P38801 184 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W GPI16P38875 610 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W ATM1P40416 690 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PAC11P40960 533 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W ROG1P53118 685 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YGR117CP53270 476 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YDR541CQ03049 344 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PRM6Q04705 352 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RIF2Q06208 395 aa2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YEF1P32622 495 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YKL097CP34245 136 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W DOA1P36037 715 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W QDR3P38227 689 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W STP2P38704 541 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W YHR131CP38835 850 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W UTP18P40362 594 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W CHS6P40955 746 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W LCB3P47013 409 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W BIR1P47134 954 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W NDL1Q06568 189 aa2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
NSE4YDL105W PLP2Q12017 286 aa2.73□□□□□ -1.97
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