RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	HXT14	P42833	540 aa		1.08	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MRM2	P53123	320 aa		1.08	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	KTR6	P54070	446 aa		1.08	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	ENT1	Q12518	454 aa		1.08	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YML133C	Q03099	1374 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YLL067C	Q07888	1374 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YLL066C	Q99208	1374 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SSH4	P32343	579 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	ECT1	P33412	323 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PFF1	P38244	976 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	COX14	P39103	70 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RMD8	P43620	662 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YJR008W	P47085	338 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	GPI15	P53961	229 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	OAZ1	Q02803	292 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MCH1	Q07376	486 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RAX1	Q08760	435 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SRL2	Q12020	392 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MET8	P15807	274 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	CLN1	P20437	546 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	OCA4	P25366	362 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SIN4	P32259	974 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PRY2	P36110	329 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	STP2	P38704	541 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PHB2	P50085	310 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YPR195C	Q06594	109 aa		1.07	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	GCN4	P03069	281 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	ZRC1	P20107	442 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YCL068C	P25593	260 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	WSS1	P38838	269 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YAL037W	P39728	267 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YER184C	P39961	794 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YMR102C	Q03177	834 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MDM30	Q05930	598 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MDM36	Q06820	579 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		1.06	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	CYM1	P32898	989 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	HAC1	P41546	238 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	AIM24	P47127	394 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	HOT1	Q03213	719 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MFG1	Q07684	458 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SMC5	Q08204	1093 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PPH22	P23595	377 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YHK8	P38776	514 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	IGD1	P43598	195 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	LCB3	P47013	409 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	CCE1	Q03702	353 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	TAF12	Q03761	539 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YDR056C	Q12025	205 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RIM20	Q12033	661 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YDR061W	Q12298	539 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	APC2	Q12440	853 aa		1.05	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SAL1	D6W196	494 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	TFB1	P32776	642 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	CHL4	P38907	458 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MAM33	P40513	266 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	CLD1	P53264	445 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	JJJ1	P53863	590 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	GIP3	Q03016	1276 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	TDA1	Q03533	586 aa		1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	PUT4	P15380	627 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	GEX1	P25596	615 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	DEP1	P31385	405 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YME2	P32843	850 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	MET18	P40469	1032 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	SPO22	P40511	975 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	YGR067C	P53243	804 aa		1.03	□□□□□ -2.24
VIK1	YPL253C	RHB1	P25378	209 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	KRE2	P27809	442 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	GPI10	P30777	616 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	PFS1	P38872	237 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	CPR7	P47103	393 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPN14	P53196	417 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SOR2	Q07786	357 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	LOT6	Q07923	191 aa		1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	YEF1	P32622	495 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	FRT2	P39734	528 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	SPO73	P40031	143 aa		1.02	□□□□□ -2.25
VIK1	YPL253C	PHO86	P46956	311 aa		1.02	□□□□□ -2.25

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms