Protein–RNA interactions for Protein: Q12034

SLF1, Protein SLF1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLF1Q12034 NSR1YGR159C 1245 nt19.74■□□□□ 0.75
SLF1Q12034 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.6■□□□□ 0.73
SLF1Q12034 NOP1YDL014W 984 nt18.91■□□□□ 0.62
SLF1Q12034 MDJ1YFL016C 1536 nt17.79■□□□□ 0.44
SLF1Q12034 YKL036CYKL036C 393 nt17.26■□□□□ 0.35
SLF1Q12034 SRX1YKL086W 384 nt16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q12034 Q0297Q0297 156 nt16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q12034 YJL027CYJL027C 417 nt16.32■□□□□ 0.2
SLF1Q12034 DBP2YNL112W 1641 nt15.74■□□□□ 0.11
SLF1Q12034 YCR051WYCR051W 669 nt15.65■□□□□ 0.1
SLF1Q12034 SCS3YGL126W 1143 nt15.64■□□□□ 0.09
SLF1Q12034 YBR190WYBR190W 312 nt15.22■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.21■□□□□ 0.03
SLF1Q12034 YOL085CYOL085C 342 nt15□□□□□ -0.01
SLF1Q12034 CCC1YLR220W 969 nt14.93□□□□□ -0.02
SLF1Q12034 RPP1BYDL130W 321 nt14.84□□□□□ -0.03
SLF1Q12034 PKP1YIL042C 1185 nt14.77□□□□□ -0.05
SLF1Q12034 RTC3YHR087W 336 nt14.76□□□□□ -0.05
SLF1Q12034 SCJ1YMR214W 1134 nt14.59□□□□□ -0.07
SLF1Q12034 RVS167YDR388W 1449 nt14.53□□□□□ -0.08
SLF1Q12034 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.26□□□□□ -0.13
SLF1Q12034 PET122YER153C 765 nt14.24□□□□□ -0.13
SLF1Q12034 PUT4YOR348C 1884 nt14.1□□□□□ -0.15
SLF1Q12034 SHR5YOL110W 714 nt14.05□□□□□ -0.16
SLF1Q12034 ATS1YAL020C 1002 nt13.9□□□□□ -0.18
SLF1Q12034 SCR1SCR1 522 nt13.9□□□□□ -0.18
SLF1Q12034 SSA3YBL075C 1950 nt13.85□□□□□ -0.19
SLF1Q12034 YDJ1YNL064C 1230 nt13.81□□□□□ -0.2
SLF1Q12034 URN1YPR152C 1398 nt13.81□□□□□ -0.2
SLF1Q12034 ARE1YCR048W 1833 nt13.77□□□□□ -0.21
SLF1Q12034 RRN5YLR141W 1092 nt13.77□□□□□ -0.21
SLF1Q12034 DEP1YAL013W 1218 nt13.71□□□□□ -0.21
SLF1Q12034 OPI9YLR338W 858 nt13.69□□□□□ -0.22
SLF1Q12034 SAH1YER043C 1350 nt13.67□□□□□ -0.22
SLF1Q12034 POA1YBR022W 534 nt13.55□□□□□ -0.24
SLF1Q12034 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.52□□□□□ -0.25
SLF1Q12034 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.52□□□□□ -0.25
SLF1Q12034 GAR1YHR089C 618 nt13.48□□□□□ -0.25
SLF1Q12034 YNL208WYNL208W 600 nt13.47□□□□□ -0.25
SLF1Q12034 RPN10YHR200W 807 nt13.46□□□□□ -0.25
SLF1Q12034 RSB1YOR049C 1065 nt13.36□□□□□ -0.27
SLF1Q12034 BSC6YOL137W 1494 nt13.34□□□□□ -0.27
SLF1Q12034 PUN1YLR414C 792 nt13.24□□□□□ -0.29
SLF1Q12034 YJR018WYJR018W 363 nt13.14□□□□□ -0.31
SLF1Q12034 PTC2YER089C 1395 nt13.14□□□□□ -0.31
SLF1Q12034 SPT5YML010W 3192 nt13.12□□□□□ -0.31
SLF1Q12034 BUD23YCR047C 828 nt13.11□□□□□ -0.31
SLF1Q12034 TIR1YER011W 765 nt13.08□□□□□ -0.32
SLF1Q12034 YJR120WYJR120W 351 nt13.06□□□□□ -0.32
SLF1Q12034 SSA1YAL005C 1929 nt13.03□□□□□ -0.32
SLF1Q12034 NAB2YGL122C 1578 nt13□□□□□ -0.33
SLF1Q12034 PST2YDR032C 597 nt12.96□□□□□ -0.33
SLF1Q12034 FIS1YIL065C 468 nt12.89□□□□□ -0.35
SLF1Q12034 SRB2YHR041C 633 nt12.86□□□□□ -0.35
SLF1Q12034 DAL1YIR027C 1383 nt12.79□□□□□ -0.36
SLF1Q12034 RPP2BYDR382W 333 nt12.73□□□□□ -0.37
SLF1Q12034 PHO4YFR034C 939 nt12.69□□□□□ -0.38
SLF1Q12034 INM2YDR287W 879 nt12.68□□□□□ -0.38
SLF1Q12034 FPR4YLR449W 1179 nt12.66□□□□□ -0.38
SLF1Q12034 SSA4YER103W 1929 nt12.61□□□□□ -0.39
SLF1Q12034 YPS1YLR120C 1710 nt12.57□□□□□ -0.4
SLF1Q12034 MEP2YNL142W 1500 nt12.57□□□□□ -0.4
SLF1Q12034 YBL100CYBL100C 315 nt12.55□□□□□ -0.4
SLF1Q12034 BDH2YAL061W 1254 nt12.54□□□□□ -0.4
SLF1Q12034 WWM1YFL010C 636 nt12.48□□□□□ -0.41
SLF1Q12034 SHU1YHL006C 453 nt12.48□□□□□ -0.41
SLF1Q12034 YDR095CYDR095C 411 nt12.45□□□□□ -0.42
SLF1Q12034 FUN26YAL022C 1554 nt12.41□□□□□ -0.42
SLF1Q12034 DCW1YKL046C 1350 nt12.39□□□□□ -0.43
SLF1Q12034 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.34□□□□□ -0.43
SLF1Q12034 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.33□□□□□ -0.44
SLF1Q12034 LSM3YLR438C-A 270 nt12.31□□□□□ -0.44
SLF1Q12034 HOM6YJR139C 1080 nt12.3□□□□□ -0.44
SLF1Q12034 YGR021WYGR021W 873 nt12.27□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 TRM9YML014W 840 nt12.27□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 CCT6YDR188W 1641 nt12.26□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 PTP1YDL230W 1008 nt12.26□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.26□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 BDF1YLR399C 2061 nt12.23□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 YKL097CYKL097C 411 nt12.22□□□□□ -0.45
SLF1Q12034 MNP1YGL068W 585 nt12.2□□□□□ -0.46
SLF1Q12034 EMI2YDR516C 1503 nt12.18□□□□□ -0.46
SLF1Q12034 ALF1YNL148C 765 nt12.18□□□□□ -0.46
SLF1Q12034 CAC2YML102W 1407 nt12.18□□□□□ -0.46
SLF1Q12034 RPP2AYOL039W 321 nt12.17□□□□□ -0.46
SLF1Q12034 SIS1YNL007C 1059 nt12.15□□□□□ -0.46
SLF1Q12034 RKM5YLR137W 1104 nt12.1□□□□□ -0.47
SLF1Q12034 YBR220CYBR220C 1683 nt12.09□□□□□ -0.47
SLF1Q12034 YDL221WYDL221W 552 nt12.08□□□□□ -0.48
SLF1Q12034 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.07□□□□□ -0.48
SLF1Q12034 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.07□□□□□ -0.48
SLF1Q12034 TAT1YBR069C 1860 nt12.05□□□□□ -0.48
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