RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRD1	YOL013C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	SCEI	P03882	235 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	RAP1	P11938	827 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	ECM25	P32525	599 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	SPR1	P32603	445 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	FRE1	P32791	686 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	RRN10	P38204	145 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	SPC97	P38863	823 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	SYG1	P40528	902 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	CDC1	P40986	491 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	TOS3	P43637	560 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	URC2	Q04411	772 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	YLR455W	Q06188	304 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	TPO3	Q06451	622 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	YPR078C	Q06813	372 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	YRM1	Q12340	786 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	YLR111W	Q12528	110 aa		3.15	□□□□□ -1.9
HRD1	YOL013C	VPS3	P23643	1011 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	GID7	P25569	745 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SHP1	P34223	423 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	EFM2	P38347	419 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ERV46	P39727	415 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	GAT2	P40209	560 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SAS2	P40963	338 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SNG1	P46950	547 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PHO86	P46956	311 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PMT5	P52867	743 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YMR087W	Q04299	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ARR1	Q06596	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RKR1	Q04781	1562 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	OPI3	P05375	206 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	CHS1	P08004	1131 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	MAS1	P10507	462 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PPZ1	P26570	692 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SUA5	P32579	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
HRD1	YOL013C	BNA4	P38169	460 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RTT107	P38850	1070 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YJL070C	P40361	888 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ATM1	P40416	690 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	DUG3	P53871	357 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YNL146W	P53906	100 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	AAT1	Q01802	451 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PET117	Q02771	107 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	BCP1	Q06338	283 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	NRT1	Q08485	598 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PEX27	Q08580	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YOR365C	Q08844	703 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RNH203	Q12338	110 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RMD5	Q12508	421 aa		3.14	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SCC2	Q04002	1493 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	CDC21	P06785	304 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	GPA1	P08539	472 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SNF3	P10870	884 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RGT1	P32862	1170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
HRD1	YOL013C	IML3	P38265	245 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	TAE1	P38340	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	INM1	P38710	295 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	RCY1	P39531	840 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	MSS2	P40990	351 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	SPG5	P42933	373 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	IRC7	P43623	340 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YJL118W	P47022	219 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	VOA1	P53262	265 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	GIM3	P53900	129 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	ATG26	Q06321	1198 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	THI3	Q07471	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
HRD1	YOL013C	YPR022C	Q12139	1133 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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