RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RAD57	P25301	460 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	NAM9	P27929	486 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	LTV1	P34078	463 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PEX5	P35056	612 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	HEL1	P36113	551 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SPG5	P42933	373 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	UAF30	Q08747	228 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	COX3	P00420	269 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YBR137W	P38276	179 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	FAD1	P38913	306 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	GAT2	P40209	560 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PIB2	P53191	635 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	VPS9	P54787	451 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	HER2	Q03557	464 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	URH1	Q04179	340 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YLR456W	Q06199	204 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SRL2	Q12020	392 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	IMA3	P0CW40	589 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	IMA4	P0CW41	589 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	IMA2	Q08295	589 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	PDE2	P06776	526 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	MNE1	P24720	663 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	MNS1	P32906	549 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YPS6	P40583	537 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	REE1	P40893	198 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	LCB2	P40970	561 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YGR210C	P42942	411 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SFH5	P47008	294 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	YJL055W	P47044	245 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	BTN2	P53286	410 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	MMT1	Q03218	510 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	BCH1	Q05029	724 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	RUP1	Q12242	671 aa		3.59	□□□□□ -1.83
YNL171C	YNL171C	TRP1	P00912	224 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	DAL2	P25335	343 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	BRO1	P48582	844 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	MTM1	P53320	366 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	STD1	Q02794	444 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	TMS1	Q12116	473 aa		3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CDC21	P06785	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	DST1	P07273	309 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	PET123	P17558	318 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	STN1	P38960	494 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	JLP2	P40206	208 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	YRM1	Q12340	786 aa		3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	ALG1	P16661	449 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	YCL068C	P25593	260 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CHK1	P38147	527 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	PAN6	P40459	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CCE1	Q03702	353 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	NDE2	Q07500	545 aa		3.56	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CYC3	P06182	269 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	MDL1	P33310	695 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	MSG5	P38590	489 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	INM1	P38710	295 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	EFM4	P40516	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RAX1	Q08760	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	CLN3	P13365	580 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	PHO91	P27514	894 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	POP5	P28005	173 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	GPI16	P38875	610 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	ROG1	P53118	685 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	NUP116	Q02630	1113 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	NSE1	Q07913	336 aa		3.54	□□□□□ -1.84
YNL171C	YNL171C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.5 ms