RNA–Protein interactions for RNA: YGR281W

YOR1, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene YOR1, Length 4,434 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YOR1	YGR281W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CTP1	P38152	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YBR071W	P38243	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SHG1	P38337	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PHO12	P38693	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MNT3	P40549	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YIR016W	P40572	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	ATG18	P43601	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PPT1	P53043	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	COR1	P07256	457 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SPO7	P18410	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YCR015C	P25616	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DOA1	P36037	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SKG1	P36169	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DSF2	P38213	736 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MUP3	P38734	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CTR1	P49573	406 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RSN1	Q03516	953 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TPP1	Q03796	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	AIM36	Q03798	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	FLC1	Q08967	793 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BAG7	Q12128	409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HSP42	Q12329	375 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BBP1	Q12365	385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SKS1	Q12505	502 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	AST1	P35183	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YOR062C	P36025	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MAF1	P41910	395 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PEX13	P80667	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SWF1	Q04629	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	BSC2	Q05611	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	FAR10	Q06001	478 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	RIB3	Q99258	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	CDC21	P06785	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SPO23	P33757	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	POA1	P38218	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	MLH1	P38920	769 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SOK1	P40317	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	HMS2	P47175	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SMA1	Q02651	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YOR1	YGR281W	TIM9	O74700	87 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	MSF1	P08425	469 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	MEF1	P25039	761 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	SIC1	P38634	284 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	CHL4	P38907	458 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	PUS2	P53167	370 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	YGR015C	P53208	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	RDI1	Q12434	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	RIM15	P43565	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	JEN1	P36035	616 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	TAE1	P38340	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	STB5	P38699	743 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	VPS36	Q06696	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	RCN2	Q12044	265 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YOR1	YGR281W	TSR4	P25040	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.4 ms