RNA–Protein interactions for RNA: YDR346C

SVF1, Transcript of Protein with a potential role in cell survival pathways, yeast

Gene SVF1, Length 1,446 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SVF1	YDR346C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	SIN4	P32259	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	DBF4	P32325	704 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	HIR2	P32480	875 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ECM25	P32525	599 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	PCA1	P38360	1216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RMT2	Q03305	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	DON1	Q05610	365 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	CLB1	P24868	471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RHB1	P25378	209 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	TFB1	P32776	642 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RFC3	P38629	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	IDP2	P41939	412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	PDR18	P53756	1333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YRF1-2	P40105	1681 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	HIP1	P06775	603 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MRP4	P32902	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YHR054C	P38780	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MLC1	P53141	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	CAF40	P53829	373 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	SKO1	Q02100	647 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ISA2	Q12425	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	DDP1	Q99321	188 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	URA4	P20051	364 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	KRE2	P27809	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ZIM17	P42844	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	GOR1	P53839	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	AIM32	Q04689	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	HNT3	Q08702	217 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	CPR3	P25719	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	DEP1	P31385	405 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ECM27	P47144	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	FRE4	P53746	719 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	GEX1	P25596	615 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	NAT2	P37293	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ARP5	P53946	755 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	SOR2	Q07786	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YPL150W	Q12152	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	HSP42	Q12329	375 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RDS1	P25611	832 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ITR1	P30605	584 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	PIM1	P36775	1133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MMS4	P38257	691 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RRT2	P38332	387 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YJL132W	P47014	750 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	YGL242C	P53066	181 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MRS2	Q01926	470 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MRP51	Q02950	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	ACL4	Q03771	387 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	MUM3	Q08750	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	BNI1	P41832	1953 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SVF1	YDR346C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	BRF1	P29056	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	YIL067C	P40514	678 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	YFL067W	P43537	175 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	HMS2	P47175	358 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	BOR1	P53838	576 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	OCA2	P53949	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	MMR1	Q06324	491 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	VPS54	Q12071	889 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	RRP5	Q05022	1729 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	SWI1	P09547	1314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	PMR1	P13586	950 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	CLN1	P20437	546 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	SLM4	P38247	162 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
SVF1	YDR346C	MST28	P39552	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	LAM5	P43560	674 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	PHB2	P50085	310 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SVF1	YDR346C	DCS1	Q06151	350 aa		4.76	□□□□□ -1.65

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