RNA–Protein interactions for RNA: snR46

snR46, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR46, Length 197 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR46	snR46	AXL2	P38928	823 aa		0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	BET5	Q03630	159 aa		0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RLM1	Q12224	676 aa		0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
snR46	snR46	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	ATP10	P18496	279 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	SAG1	P20840	650 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	AGA2	P32781	87 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	CYM1	P32898	989 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	THI2	P38141	450 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	JLP2	P40206	208 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HAC1	P41546	238 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	EGT2	P42835	1041 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YJL144W	P47009	104 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	BNS1	P50084	137 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YGR067C	P53243	804 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YSA1	Q01976	231 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	NAG1	Q8TGN9	163 aa		0.52	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	KAR3	P17119	729 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	GYP6	P32806	458 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	AST1	P35183	429 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	ATG18	P43601	500 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PET130	P47065	347 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	REX4	Q08237	289 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	SGT1	Q08446	395 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YPT6	Q99260	215 aa		0.51	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	CLN1	P20437	546 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PPQ1	P32945	549 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	SBE22	P38814	852 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PFS1	P38872	237 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HMS2	P47175	358 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	MST27	P53176	234 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	FIN1	Q03898	291 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HSP31	Q04432	237 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	BCH1	Q05029	724 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YEH1	Q07804	573 aa		0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	GAL80	P04387	435 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	ZIP1	P31111	875 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	COX13	P32799	129 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HEL1	P36113	551 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	CCT6	P39079	546 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	COX14	P39103	70 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	MAM33	P40513	266 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	MRM2	P53123	320 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YGL108C	P53139	140 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HST4	P53688	370 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	ALF1	P53904	254 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	GTR1	Q00582	310 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	FAR10	Q06001	478 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	ORT1	Q12375	292 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	RTP1	Q12751	981 aa		0.49	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	RHO2	P06781	192 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	AFG1	P32317	509 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YPS1	P32329	569 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PTH2	P34222	208 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	MUM2	P38236	366 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	CHL4	P38907	458 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	AIM24	P47127	394 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	UBX4	P54730	416 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	HUA2	Q12134	243 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	AVL9	Q12500	764 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		0.48	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	RAD57	P25301	460 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PRD1	P25375	712 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	CHS3	P29465	1165 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	DEP1	P31385	405 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	TFB1	P32776	642 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	SAP185	P40856	1058 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	SFH5	P47008	294 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	COQ5	P49017	307 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	CLD1	P53264	445 aa		0.47	□□□□□ -2.33
snR46	snR46	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	PEX22	P39718	180 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SCC4	P40090	624 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	ESL1	P40456	1118 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.46	□□□□□ -2.34	not detected
snR46	snR46	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YGR021W	P53212	290 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	NRM1	P53718	249 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	YLR345W	Q06137	509 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SMC5	Q08204	1093 aa		0.46	□□□□□ -2.34
snR46	snR46	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms