RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A VPS38Q05919 439 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ARR1Q06596 294 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PUT4P15380 627 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A MSM1P22438 575 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A BUD5P25300 642 aaPredicted RBP0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YBR138CP38277 524 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SLZ1P40167 298 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SNO4Q04902 237 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A HSP33Q08914 237 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A HSP32Q08992 237 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YER078W-AQ3E7A2 54 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A FUM1P08417 488 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A IME2P32581 645 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A STU1P38198 1513 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SBE22P38814 852 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CHS6P40955 746 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A TRF5P48561 642 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YGR066CP53242 292 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A FRE4P53746 719 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RTN2Q12443 393 aa0.2□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A NUP192P47054 1683 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A BCK1Q01389 1478 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SNT2P53127 1403 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ECM25P32525 599 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YFR054CP43622 192 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A AIM24P47127 394 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A GPG1P53130 126 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ODC1Q03028 310 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CCE1Q03702 353 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RTN1Q04947 295 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RIF2Q06208 395 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SIL1Q08199 421 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RFM1Q12192 310 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A TFC7Q12415 435 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A AVL9Q12500 764 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A BUD3P25558 1636 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CUP1-1P0CX80 61 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CUP1-2P0CX81 61 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CMK2P22517 447 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A XRS2P33301 854 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CSE2P33308 149 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SPC34P36131 295 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ATG12P38316 186 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data0.19□□□□□ -2.38not detected
YPL060C-AYPL060C-A EAF7P53911 425 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SPR6Q01684 191 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SOV1Q04748 898 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A TMS1Q12116 473 aa0.19□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PWP1P21304 576 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A DBF20P32328 564 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SSE2P32590 693 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A DOA1P36037 715 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YKL071WP36086 256 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A FAU1P40099 211 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SAP185P40856 1058 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A MRM2P53123 320 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A GAS2Q06135 555 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A GLE1Q12315 538 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A HSP42Q12329 375 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A LDB17Q12342 491 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CHD1P32657 1468 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A DST1P07273 309 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A MRP13P12686 339 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A GLK1P17709 500 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A OLE1P21147 510 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A TIP1P27654 210 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A STB1P42845 420 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YGL138CP53122 345 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YKU80Q04437 629 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A MRPL35Q06678 367 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PCL9Q12477 304 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A MRS3P10566 314 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ZRC1P20107 442 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ISY1P21374 235 aaPredicted RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CDC50P25656 391 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YIM1P28625 365 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YBR225WP38321 900 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A HAT2P39984 401 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A PKP2P53170 491 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YMR102CQ03177 834 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ETT1Q08421 412 aaKnown RBP0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YPL150WQ12152 901 aa0.18□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A TOP2P06786 1428 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CDC21P06785 304 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A CHS1P08004 1131 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A NFT1P0CE68 1218 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A UBC1P21734 215 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YER130CP39959 443 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A UPF3P48412 387 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A LOT6Q07923 191 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A ERV2Q12284 196 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A MSI1P13712 422 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A YCL049CP25577 312 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A DPB3P27344 201 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A UTR4P32626 227 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A SNU114P36048 1008 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A LCB3P47013 409 aa0.17□□□□□ -2.38
YPL060C-AYPL060C-A RGM1Q00453 211 aa0.17□□□□□ -2.38
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