RNA–Protein interactions for RNA: YGL246C

RAI1, Transcript of Nuclear protein with decapping endonuclease activity, yeast

Gene RAI1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAI1	YGL246C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RAI1	YGL246C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SEC63	P14906	663 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ECM25	P32525	599 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ARA1	P38115	344 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	PCA1	P38360	1216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	POP6	P53218	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	TLG2	Q08144	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	CBS2	P14905	389 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	MRP4	P32902	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YCR041W	P37265	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	RFC3	P38629	340 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	COS5	P47187	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YIP1	P53039	248 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	COS7	Q07788	383 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	HSP42	Q12329	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YCR051W	P25631	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SIN4	P32259	974 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YME2	P32843	850 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	PIM1	P36775	1133 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SAS2	P40963	338 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ECM27	P47144	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YGL138C	P53122	345 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	PCP1	P53259	346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	MRP51	Q02950	344 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ISN1	Q99312	450 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	KRE2	P27809	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SSU1	P41930	458 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SSN8	P47821	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	MUM3	Q08750	479 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	CHS1	P08004	1131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	PDX1	P16451	410 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	HEM15	P16622	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	GEX1	P25596	615 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	NAT2	P37293	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	AVT5	P38176	459 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YHR054C	P38780	354 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	IBD2	P53892	351 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SKO1	Q02100	647 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ROY1	Q04847	553 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	DON1	Q05610	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	VAM3	Q12241	283 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	RPC53	P25441	422 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	ADK2	P26364	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	MIX23	P38162	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	YPI1	P43587	155 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	MDM30	Q05930	598 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RAI1	YGL246C	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	STB6	P36085	766 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	MST28	P39552	234 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	RRN11	Q04712	507 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	SRB8	P25648	1427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	HIR2	P32480	875 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	YFL067W	P43537	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	SGT1	Q08446	395 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	AFI1	Q99222	893 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	RAD61	Q99359	647 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	RHB1	P25378	209 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	SPS22	P25380	463 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	BEM1	P29366	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	YNR048W	P53740	393 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	ESA1	Q08649	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	TIM18	Q08749	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
RAI1	YGL246C	YGL242C	P53066	181 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	RSA1	Q08932	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	ERV2	Q12284	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAI1	YGL246C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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