RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C NIP100P33420 868 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C STB6P36085 766 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C VHC1P38329 1120 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MTC6P38849 526 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ISC1P40015 477 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C FMS1P50264 508 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C BNI5P53890 448 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NCS2P53923 493 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YDR131CQ03899 556 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MHR1Q06630 226 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ISN1Q99312 450 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YLR278CQ05854 1341 aa1.71□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SUP35P05453 685 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HIP1P06775 603 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RIP1P08067 215 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PRP21P32524 280 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YME2P32843 850 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ARA1P38115 344 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CCT2P39076 527 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C REE1P40893 198 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YGR210CP42942 411 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C AVT4P50944 713 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SDT1P53078 280 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PCP1P53259 346 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C DSL1P53847 754 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ROY1Q04847 553 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C AFI1Q99222 893 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SOD1P00445 154 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YAR066WP0CX18 203 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YHR214WP0CX19 203 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SRV2P17555 526 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SNT1P25357 1226 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YCR100CP25606 316 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NDI1P32340 513 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C NTC20P38302 140 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C GCD10P41814 478 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RRT5P43607 289 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TRS85P46944 698 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C COS5P47187 383 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YGL138CP53122 345 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C OGG1P53397 376 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PNG1Q02890 363 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C KAP120Q02932 1032 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PIR3Q03180 325 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YDR387CQ04162 555 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HSP31Q04432 237 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ERB1Q04660 807 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C COS7Q07788 383 aa1.7□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SEC63P14906 663 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HEM15P16622 393 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C URA7P28274 579 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C DBF4P32325 704 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C APE2P32454 952 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C GLC7P32598 312 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YCR041WP37265 110 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SAS2P40963 338 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YIP1P53039 248 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C POP6P53218 158 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ART5P53244 586 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YIF1P53845 314 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YLR152CP54072 576 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SKO1Q02100 647 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RMT2Q03305 412 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RRN11Q04712 507 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C DON1Q05610 365 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C VAM3Q12241 283 aa1.69□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CHS1P08004 1131 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RPI1P23250 407 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CLB1P24868 471 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C KRE2P27809 442 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ERV1P27882 189 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ARO2P28777 376 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C BEM1P29366 551 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CRM1P30822 1084 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C SIN4P32259 974 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HIR2P32480 875 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ECM25P32525 599 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C TFB1P32776 642 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ODC1Q03028 310 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YLR345WQ06137 509 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HSP42Q12329 375 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ISA2Q12425 185 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C HIS4P00815 799 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C CPR1P14832 162 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RHB1P25378 209 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C DEG1P31115 442 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C VMA8P32610 256 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PRS1P32895 427 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C MRP4P32902 394 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data1.68□□□□□ -2.14not detected
HDA3YPR179C YBL059WP34224 193 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C PIM1P36775 1133 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C RFC3P38629 340 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YHR054CP38780 354 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C YIL067CP40514 678 aa1.68□□□□□ -2.14
HDA3YPR179C ZIM17P42844 174 aa1.68□□□□□ -2.14
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