RNA–Protein interactions for RNA: YLL049W

LDB18, Transcript of Component of the dynactin complex, yeast

Gene LDB18, Length 540 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LDB18	YLL049W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
LDB18	YLL049W	TIS11	P47977	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	MDM34	P53083	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	ROG1	P53118	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	VPS75	P53853	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	ALF1	P53904	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	SOV1	Q04748	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	RSA1	Q08932	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	RGT2	Q12300	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	YRM1	Q12340	786 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	BPH1	P25356	2167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LDB18	YLL049W	STE3	P06783	470 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ATP12	P22135	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MEF1	P25039	761 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPN12	P32496	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PEX5	P35056	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YAR028W	P39548	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	FRT2	P39734	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SCC4	P40090	624 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SNO3	P43544	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ECO1	P43605	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BTN2	P53286	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CUZ1	P53899	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
LDB18	YLL049W	COR1	P07256	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CDC5	P32562	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	OAR1	P35731	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MAL32	P38158	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SIT1	P39980	628 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YMR134W	P40207	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	XBP1	P40489	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	APQ12	P40532	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YJL043W	P47053	257 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BOP2	Q06150	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MCH5	Q08777	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PUS9	Q12069	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RSR1	P13856	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CDC20	P26309	610 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	HXT4	P32467	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SRB4	P32569	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	EFM1	P38732	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YHI9	P38765	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	APE4	P38821	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	HXT7	P39004	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	HAT2	P39984	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	LYS5	P50113	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	GAS3	Q03655	524 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	BCH1	Q05029	724 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PTC6	P25646	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ERG9	P29704	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	OMA1	P36163	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	APT2	P36973	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	PAC11	P40960	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MDV1	P47025	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YGR067C	P53243	804 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	CRR1	Q05790	422 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	GAS2	Q06135	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SLP1	Q12232	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	FLO9	P39712	1322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ADE8	P04161	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ERG8	P24521	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	RAD57	P25301	460 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	ZIP1	P31111	875 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	SDH3	P33421	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LDB18	YLL049W	TUL1	P36096	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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