RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W YPL068CQ02749 293 aa12.35□□□□□ -0.43
SSA4YER103W YDR249CQ03787 373 aa12.35□□□□□ -0.43
SSA4YER103W ECM11Q04110 302 aa12.35□□□□□ -0.43
SSA4YER103W YMR321CQ04898 105 aa12.35□□□□□ -0.43
SSA4YER103W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
SSA4YER103W SIR3P06701 978 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W MSM1P22438 575 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W CAM1P29547 415 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W ERG9P29704 444 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W VPS29P38759 282 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W OPT1P40897 799 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W PHB1P40961 287 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W MKC7P53379 596 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W CAF40P53829 373 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W CDC14Q00684 551 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W OPT2Q06593 877 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W APC2Q12440 853 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W SNF8Q12483 233 aa12.34□□□□□ -0.43
SSA4YER103W AMD1P15274 810 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YHR033WP38690 423 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W VRG4P40107 337 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W PRE6P40303 254 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W MDV1P47025 714 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W TOM22P49334 152 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W BRE5P53741 515 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W MRPS16Q02608 121 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W RTN2Q12443 393 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YKR051WP36142 418 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W STB5P38699 743 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W EFM1P38732 585 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YAP1801P38856 637 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W LSM1P47017 172 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W GRX8Q05926 109 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W DDC1Q08949 612 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W LDB19Q12502 818 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa12.33□□□□□ -0.44
SSA4YER103W ADE4P04046 510 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W DST1P07273 309 aa12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W KIN3P22209 435 aa12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W SSO1P32867 290 aa12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W DOT6P40059 670 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W ATH1P48016 1211 aa12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W NUP100Q02629 959 aa12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SSA4YER103W RAD52P06778 471 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W SAM35P14693 329 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W TSL1P38427 1098 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W BIG1P38813 335 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W DHH1P39517 506 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W ACO2P39533 789 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W NTA1P40354 457 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W AAD14P42884 376 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W ECM27P47144 725 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W MPS2P53159 387 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W FMP48P53233 369 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W AIM36Q03798 255 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W UPC2Q12151 913 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W AFI1Q99222 893 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W GAC1P28006 793 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W APT2P36973 181 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W MEP2P41948 499 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W UBC12P52491 188 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W MPC1P53157 130 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YLR283WQ05867 314 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YOL131WQ08270 108 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W APC5Q08683 685 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data12.31□□□□□ -0.44not detected
SSA4YER103W ICT1Q12385 394 aa12.31□□□□□ -0.44
SSA4YER103W FLP1P03870 423 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W FUS1P11710 512 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W CNB1P25296 175 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YIH1P25637 258 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W STP2P38704 541 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W LSM7P53905 115 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W MSC2Q03455 724 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W NSE5Q03718 556 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W TIF35Q04067 274 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YOL107WQ12239 342 aa12.3□□□□□ -0.44
SSA4YER103W HIS1P00498 297 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W SPT3P06844 337 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W GAL2P13181 574 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W GLN3P18494 730 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YRO2P38079 344 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W EDC3P39998 551 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YER186CP40101 306 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YFL066CP43538 392 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W RMD8P43620 662 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W SHY1P53266 389 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W NUP116Q02630 1113 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YDR514CQ04408 483 aa12.29□□□□□ -0.44
SSA4YER103W YLR224WQ05947 369 aa12.29□□□□□ -0.44
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