RNA–Protein interactions for RNA: Q0032

Q0032, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0032, Length 291 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0032	Q0032	TCO89	Q08921	799 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	JID1	Q12350	301 aa		0.26	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	YPR096C	O13587	100 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	PUT4	P15380	627 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	MAL33	P38157	468 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	OM14	P38325	134 aa		0.25	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.25	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	CDC50	P25656	391 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	AAD10	P47182	288 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	YIP1	P53039	248 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	not detected
Q0032	Q0032	CTI6	Q08923	506 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	TRM8	Q12009	286 aa		0.24	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	TOP1	P04786	769 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	COR1	P07256	457 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	YHL041W	P38730	149 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	AFG3	P39925	761 aa		0.23	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.22	□□□□□ -2.37	not detected
Q0032	Q0032	YFR057W	P43625	151 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	YJR030C	P47101	745 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	LCL3	P53153	274 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	IPI3	P53877	555 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	MTQ1	P53944	314 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	NUP116	Q02630	1113 aa		0.22	□□□□□ -2.37
Q0032	Q0032	PRR1	P28708	518 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	MFB1	Q04922	465 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	YPL272C	Q08984	517 aa		0.21	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	PHO81	P17442	1178 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	PTP2	P29461	750 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	PPQ1	P32945	549 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	MBB1	P39534	108 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	RIF2	Q06208	395 aa		0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	0.2	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	ECT1	P33412	323 aa		0.19	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	EGT2	P42835	1041 aa		0.19	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	BNS1	P50084	137 aa		0.19	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	MSM1	P22438	575 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	AST1	P35183	429 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	YIR035C	P40579	254 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	URB2	P47108	1174 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	YGR067C	P53243	804 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	RAV1	P47104	1357 aa		0.18	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	MSI1	P13712	422 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	YIH1	P25637	258 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	SKN1	P33336	771 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	MSR1	P38714	643 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	ERP2	P39704	215 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	FRE4	P53746	719 aa		0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	ECM25	P32525	599 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	CBP4	P37267	147 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	CHL4	P38907	458 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	FHL1	P39521	936 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	IGD1	P43598	195 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	ATG18	P43601	500 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	BNA1	P47096	177 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	YML037C	Q03703	340 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	RAD30	Q04049	632 aa		0.16	□□□□□ -2.38
Q0032	Q0032	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	JLP2	P40206	208 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	SOV1	Q04748	898 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	BLS1	Q06071	122 aa		0.15	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	SCC4	P40090	624 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	HST4	P53688	370 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	YNR048W	P53740	393 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	RGM1	Q00453	211 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	SNO4	Q04902	237 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	FAR10	Q06001	478 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	HSP32	Q08992	237 aa		0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	0.14	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	PFS1	P38872	237 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	ACA1	P39970	489 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	AZR1	P50080	613 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	VPS38	Q05919	439 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	SPE4	Q12455	300 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	YOL087C	Q99247	1116 aa		0.13	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	ZRC1	P20107	442 aa		0.12	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	POL4	P25615	582 aa		0.12	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	MKK1	P32490	508 aa		0.12	□□□□□ -2.39
Q0032	Q0032	YIL029C	P40538	142 aa		0.12	□□□□□ -2.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms