RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	SPO74	P45819	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	AIM23	P47015	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	YNL143C	P53908	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MFG1	Q07684	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	NTG2	Q08214	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
PUS1	YPL212C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	LCB4	Q12246	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	SPT3	P06844	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MAS1	P10507	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	CBS2	P14905	389 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MET22	P32179	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MRPL6	P32904	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	SGE1	P33335	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	ECM8	P38246	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	PEX18	P38855	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MTG2	P38860	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
PUS1	YPL212C	JLP2	P40206	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	EFM3	P47163	339 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	GPI8	P49018	411 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	YNL018C	P53976	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	HXT15	P54854	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	RRN5	Q02983	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	RSC9	Q03124	581 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	PIR3	Q03180	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	SPO71	Q03868	1245 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MDM36	Q06820	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	THP1	Q08231	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	MED2	Q12124	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUS1	YPL212C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	TIM9	O74700	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	SPS1	P08458	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	MRPL8	P22353	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
PUS1	YPL212C	SFP1	P32432	683 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	GLG1	P36143	616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	SIF2	P38262	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	BMT2	P38278	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YHR078W	P38799	552 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	IPT1	P38954	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	MEP2	P41948	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	GYP8	P43570	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	COQ6	P53318	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	RNH70	P53331	553 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	COG5	P53951	403 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	FMP30	Q02883	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	RPN4	Q03465	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	SPR28	Q04921	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	BSC2	Q05611	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	OPT2	Q06593	877 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	UIP4	Q08926	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	FLC1	Q08967	793 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	TRM10	Q12400	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	DST1	P07273	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	ADK2	P26364	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	TIP20	P33891	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	THI80	P35202	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YKR051W	P36142	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	SLX1	P38324	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	EMP65	P40085	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	PTR3	P43606	678 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	BFA1	P47113	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	COG1	P53079	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YGR035C	P53222	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	GOR1	P53839	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	YNL260C	P53846	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	HER2	Q03557	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	TGL5	Q12043	749 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUS1	YPL212C	UPC2	Q12151	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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