RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W TMN3P40071 706 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CAB2P40506 365 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TNA1P53322 534 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CAB4P53332 305 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W VAC7P53950 1165 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W BUD7Q08754 746 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RFM1Q12192 310 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NFI1Q12216 726 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W UBR2Q07963 1872 aa2.79□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HTS1P07263 546 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NPT1P39683 429 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LCB2P40970 561 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RAX1Q08760 435 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W SEC12P11655 471 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
SIN3YOL004W CBP3P21560 335 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PRP28P23394 588 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CDC15P27636 974 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PRR1P28708 518 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HIS7P33734 552 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
SIN3YOL004W ZIM17P42844 174 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MAD3P47074 515 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YML119WQ03208 357 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NGL3Q03210 505 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W ENV7Q12003 364 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W HER1Q12276 1246 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W CMP2P14747 604 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PUT4P15380 627 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W STE50P25344 346 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RIB7P33312 244 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W KKQ8P36004 724 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W GIM4P40005 111 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W PKP1P40530 394 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RPL6AQ02326 176 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RRN5Q02983 363 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W TAF11Q04226 346 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W RAD33Q04231 177 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W YPR172WQ06608 200 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W LDB18Q07887 179 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W MDY2Q12285 212 aa2.78□□□□□ -1.96
SIN3YOL004W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
SIN3YOL004W KSS1P14681 368 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MER1P16523 270 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PPH21P23594 369 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PRE3P38624 215 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RPP1P38786 293 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YER010CP40011 234 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W FKH2P41813 862 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W EXG2P52911 562 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CPR6P53691 371 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PRM1P53835 661 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YNL165WP53891 406 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W GIM3P53900 129 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PSR1Q07800 427 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TRE1Q08919 783 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RTN2Q12443 393 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W NAG1Q8TGN9 163 aa2.78□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PMA2P19657 947 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MGT1P26188 188 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TPS2P31688 896 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SPC34P36131 295 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W COS111P38308 924 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TCD1P38756 429 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W FLC2P39719 783 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W GAT1P43574 510 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SKP1P52286 194 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YNL058CP53947 316 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W THI20Q08224 551 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W NDI1P32340 513 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SIP2P34164 415 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PHO11P35842 467 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MYO3P36006 1272 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ECM21P38167 1117 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SAP30P38429 201 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W PHO12P38693 467 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W RRF1P38771 230 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W SOK1P40317 901 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YFR020WP43600 232 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ARC1P46672 376 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W CUE3P53137 624 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YNL247WP53852 767 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TRI1Q05024 226 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W ECI1Q05871 280 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W TEN1Q07921 160 aa2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SIN3YOL004W MAK31P23059 88 aa2.77□□□□□ -1.97
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