RNA–Protein interactions for RNA: YGL019W

CKB1, Transcript of Beta regulatory subunit of casein kinase 2 (CK2), yeast

Gene CKB1, Length 837 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CKB1	YGL019W	YOL131W	Q08270	108 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	BUD7	Q08754	746 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	TGL5	Q12043	749 aa		7.3	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YAR066W	P0CX18	203 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YHR214W	P0CX19	203 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	ENA1	P13587	1091 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	MNE1	P24720	663 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	RHB1	P25378	209 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	GEX1	P25596	615 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	LIP5	P32875	414 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	HCS1	P34243	683 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	GEX2	P36173	615 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	FMP23	P38231	175 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YHR112C	P38716	378 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	ARN2	P38724	620 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YFL052W	P43551	465 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	AIM22	P47051	409 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	BIR1	P47134	954 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	NNF1	P47149	201 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YJR124C	P47159	448 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	ROM1	P53046	1155 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SPC105	P53148	917 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	VPS62	P53285	467 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YNL260C	P53846	198 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	ENA2	Q01896	1091 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	MET31	Q03081	177 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YMR206W	Q03695	313 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	NDD1	Q08887	554 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	ENA5	Q12691	1091 aa		7.29	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	STE3	P06783	470 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	CDC4	P07834	779 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	HMG2	P12684	1045 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	UNG1	P12887	359 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	MET8	P15807	274 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SDH2	P21801	266 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SEC17	P32602	292 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SSN3	P39073	555 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	EXO1	P39875	702 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	RPH1	P39956	796 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	DDI1	P40087	428 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	COG3	P40094	801 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	MPM1	P40364	252 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	GOR1	P53839	350 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SMA1	Q02651	245 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	PIR1	Q03178	341 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	VHS1	Q03785	461 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	CIA1	Q05583	330 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	ARR1	Q06596	294 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	BSP1	Q06604	576 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	RSC3	Q06639	885 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SWA2	Q06677	668 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	UIP4	Q08926	304 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YPQ1	Q12010	308 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YLR125W	Q12138	136 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	SRF1	Q12516	437 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	MHT1	Q12525	324 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	YOR338W	Q99326	363 aa		7.28	□□□□□ -1.24
CKB1	YGL019W	PHO5	P00635	467 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	PUT2	P07275	575 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	NFT1	P0CE68	1218 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	KAR1	P11927	433 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	PDE1	P22434	369 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	COS111	P38308	924 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	YHR078W	P38799	552 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	YEL020C	P39994	560 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	SPO73	P40031	143 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	FCY21	P40039	528 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	SNF12	P53628	566 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	FRE4	P53746	719 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	IGO1	P53897	168 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	YNL140C	P53910	189 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	PEX10	Q05568	337 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	MRX10	Q05648	414 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	GRS2	Q06817	618 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	SGO1	Q08490	590 aa		7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
CKB1	YGL019W	MNL2	Q12205	849 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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