RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	GAC1	P28006	793 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	IME2	P32581	645 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	OCT1	P35999	772 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RRT2	P38332	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SAE2	P46946	345 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YGR149W	P48236	432 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YGR126W	P53274	230 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YPR003C	P53394	754 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RTT109	Q07794	436 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	DCI1	Q08558	271 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PUT2	P07275	575 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MAK32	P23060	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	DPH2	P32461	534 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	KDX1	P36005	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	DAD2	P36162	133 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PAC2	P39937	518 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CDC1	P40986	491 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	STU2	P46675	888 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	NET1	P47035	1189 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	UBP8	P50102	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SWF1	Q04629	336 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RSF1	Q05043	376 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
NUS1	YDL193W	MCH4	Q08268	501 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	APC2	Q12440	853 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	STF1	P01098	86 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	HIP1	P06775	603 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CHO1	P08456	276 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SPO11	P23179	398 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YCR006C	P25350	157 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YMC1	P32331	307 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	GYP6	P32806	458 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SHP1	P34223	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	UIP5	P36137	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SLM4	P38247	162 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ARN1	P38731	627 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	GND2	P53319	492 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	DSL1	P53847	754 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	TAP42	Q04372	366 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ERV41	Q04651	352 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PDR8	Q06149	701 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	BSP1	Q06604	576 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	VPS54	Q12071	889 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	EDE1	P34216	1381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CBP1	P07252	654 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MER1	P16523	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YPT53	P36019	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	HEL1	P36113	551 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ARA1	P38115	344 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
NUS1	YDL193W	POP2	P39008	433 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ATG27	P46989	271 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	RSM23	Q01163	450 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YPL107W	Q02873	248 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	AEP3	Q12089	606 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	FRE6	Q12473	712 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	CAT8	P39113	1433 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PET123	P17558	318 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	SPO7	P18410	259 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MRPL25	P23369	157 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PPH22	P23595	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MSP1	P28737	362 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	AFG1	P32317	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	REC114	P32841	428 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	MMS4	P38257	691 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	YHR210C	P38893	341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NUS1	YDL193W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74

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