RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W NPL4P33755 580 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W BDP1P46678 594 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-JR2P47099 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-DR1Q03856 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-BRQ12217 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-NL2Q12470 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-GR2Q12485 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W HSL1P34244 1518 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W YDL176WQ12027 708 aa8.46□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W GCD11P32481 527 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W TFB4Q12004 338 aa8.45□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W SEC2P17065 759 aa8.43□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W CSC1Q06538 782 aa8.42□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W HED1Q03937 162 aa8.41□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W YDR090CQ03193 310 aa8.4□□□□□ -1.06
TRM10YOL093W KIC1P38692 1080 aa8.39□□□□□ -1.07
TRM10YOL093W RRN7P40992 514 aa8.39□□□□□ -1.07
TRM10YOL093W SSN2P38931 1420 aa8.37□□□□□ -1.07
TRM10YOL093W KOG1P38873 1557 aa8.36□□□□□ -1.07
TRM10YOL093W ASH1P34233 588 aa8.32□□□□□ -1.08
TRM10YOL093W PAT1P25644 796 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRM10YOL093W MTC5Q03897 1148 aa8.31□□□□□ -1.08
TRM10YOL093W MET32Q12041 191 aa8.3□□□□□ -1.08
TRM10YOL093W HIR3P47171 1648 aa8.29□□□□□ -1.08
TRM10YOL093W DNA2P38859 1522 aa8.28□□□□□ -1.08
TRM10YOL093W AFT1P22149 690 aa8.27□□□□□ -1.09
TRM10YOL093W RRD1P40454 393 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TRM10YOL093W ORC6P38826 435 aa8.26□□□□□ -1.09
TRM10YOL093W HST3P53687 447 aa8.26□□□□□ -1.09
TRM10YOL093W IFH1P39520 1085 aa8.23□□□□□ -1.09
TRM10YOL093W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
TRM10YOL093W YJR115WP47152 169 aa8.18□□□□□ -1.1
TRM10YOL093W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
TRM10YOL093W CAF120P53836 1060 aa8.16□□□□□ -1.1
TRM10YOL093W THO2P53552 1597 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
TRM10YOL093W MOD5P07884 428 aa8.14□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W PUS5Q06244 254 aa8.14□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W KEX2P13134 814 aa8.13□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W PAC1P39946 494 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W ERF2Q06551 359 aa8.13□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W YPR109WQ06104 294 aa8.12□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W REV3P14284 1504 aa8.12□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W SIN3P22579 1536 aa8.09□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W BUD4P47136 1447 aa8.09□□□□□ -1.11
TRM10YOL093W ACO2P39533 789 aa8.08□□□□□ -1.12
TRM10YOL093W TRK2P28584 889 aa8.07□□□□□ -1.12
TRM10YOL093W RGR1P19263 1082 aa8.06□□□□□ -1.12
TRM10YOL093W YGR035CP53222 116 aa8.04□□□□□ -1.12
TRM10YOL093W SSK2P53599 1579 aa8.02□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W AGE1Q04412 482 aa8□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W OPT2Q06593 877 aa8□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W TUB4P53378 473 aa7.99□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W ATG2P53855 1592 aa7.97□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W ECM5Q03214 1411 aa7.97□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W MDS3P53094 1487 aa7.97□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W ESP1Q03018 1630 aa7.96□□□□□ -1.13
TRM10YOL093W HPF1Q05164 967 aa7.95□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W COX6P00427 148 aa7.94□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W YLR346CQ06139 101 aa7.94□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W TAF2P23255 1407 aa7.93□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W YIR007WP40566 764 aa7.92□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W UGA3P26370 528 aa7.91□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W SRF1Q12516 437 aa7.91□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W YPR148CQ06523 435 aa7.9□□□□□ -1.14
TRM10YOL093W PEP1P32319 1579 aa7.89□□□□□ -1.15
TRM10YOL093W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRM10YOL093W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TRM10YOL093W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRM10YOL093W SCW11P53189 542 aa7.85□□□□□ -1.15
TRM10YOL093W LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
TRM10YOL093W ICP55P40051 511 aa7.83□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W KXD1P53158 218 aa7.83□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W TPD3P31383 635 aa7.82□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W TY1A-BLQ12266 440 aa7.82□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W YPK9Q12697 1472 aa7.81□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W RTF1P53064 558 aa7.81□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W YPR204WQ08995 1032 aa7.81□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W MIP1P15801 1254 aa7.8□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W NUP85P46673 744 aa7.8□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W HXT10P43581 546 aa7.79□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W YNL115CP53925 644 aa7.78□□□□□ -1.16
TRM10YOL093W VPS70P47161 811 aa7.77□□□□□ -1.17
TRM10YOL093W SCC2Q04002 1493 aa7.75□□□□□ -1.17
TRM10YOL093W PDC1P06169 563 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
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