RNA–Protein interactions for RNA: YBR084W

MIS1, Transcript of Mitochondrial C1-tetrahydrofolate synthase, yeast

Gene MIS1, Length 2,928 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIS1	YBR084W	YDL144C	Q07589	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS1	YBR084W	RAD2	P07276	1031 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS1	YBR084W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MIS1	YBR084W	SPO14	P36126	1683 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MIS1	YBR084W	PCT1	P13259	424 aa		4.96	□□□□□ -1.61
MIS1	YBR084W	TAF5	P38129	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
MIS1	YBR084W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	BUD3	P25558	1636 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	DOP1	Q03921	1698 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	MET10	P39692	1035 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	YSP2	Q06681	1438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	MSP1	P28737	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	RLF2	Q12495	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	DMA2	P53924	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	NST1	P53935	1240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	COG8	Q04632	607 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	PSH1	Q12161	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	TRM3	Q07527	1436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	DRS2	P39524	1355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	SWE1	P32944	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	PDR11	P40550	1411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	DJP1	P40564	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	VMR1	P38735	1592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	IML1	P47170	1584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	SPE2	P21182	396 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	BNR1	P40450	1375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MIS1	YBR084W	ESC2	Q06340	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	SIR4	P11978	1358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	ATG36	P46983	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	CTR9	P89105	1077 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	ITC1	P53125	1264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	RTG3	P38165	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	FKH1	P40466	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	YGR130C	P53278	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	MET5	P47169	1442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	NUP192	P47054	1683 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	KRE5	P22023	1365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	YPP1	P46951	817 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	TCD1	P38756	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	TEA1	P47988	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	TPM2	P40414	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	POL32	P47110	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	LCD1	Q04377	747 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	YIL092W	P40497	633 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	SAP155	P43612	1002 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	SMC3	P47037	1230 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	HAP5	Q02516	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	TRK1	P12685	1235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	SRS2	P12954	1174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	DAL5	P15365	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MIS1	YBR084W	USO1	P25386	1790 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	ENV11	P53246	860 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	TPO2	P53283	614 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	BRL1	P38770	471 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	TPD3	P31383	635 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	RAD50	P12753	1312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	RSC1	P53236	928 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	LAM6	Q08001	693 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	MIC60	P36112	540 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	HIF1	Q12373	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	RAD9	P14737	1309 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	BDH2	P39713	417 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	RSM25	P40496	264 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MIS1	YBR084W	PRD1	P25375	712 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms