RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	ESL1	P40456	1118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	LYS14	P40971	790 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	ATG27	P46989	271 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SGM1	P47166	707 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	FYV6	P53913	173 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	NUP100	Q02629	959 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	INA17	Q02888	182 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SML1	Q04964	104 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SYO1	Q07395	620 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	IES3	Q12345	250 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YPK9	Q12697	1472 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	REP1	P03871	373 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	RED1	P14291	827 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	NFU1	P32860	256 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YKL050C	P35736	922 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YBL028C	P38202	106 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	PHO90	P39535	881 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YGL260W	P53056	76 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	MPS2	P53159	387 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	BSC5	P53755	489 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	GIM3	P53900	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YMR102C	Q03177	834 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	VTI1	Q04338	217 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	RSF1	Q05043	376 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	ENT4	Q07872	247 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	NMT1	P14743	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	GID7	P25569	745 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	ACP1	P32463	125 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	TRS65	P32893	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YBR242W	P38331	238 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	RTS1	P38903	757 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	UIP3	P39547	235 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	TMA108	P40462	946 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	AZF1	P41696	914 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SNX4	P47057	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	ILM1	P47155	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	AAD10	P47182	288 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	SRB7	P47822	140 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	HST1	P53685	503 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	CDC45	Q08032	650 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	TRM3	Q07527	1436 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	PEP1	P32319	1579 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REX4	YOL080C	CDC16	P09798	840 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	SNF3	P10870	884 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	SPE2	P21182	396 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	SAN1	P22470	610 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	PRE8	P23639	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	RPC53	P25441	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	KAR9	P32526	644 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	SMI1	P32566	505 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	PTR2	P32901	601 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	ERG7	P38604	731 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	RTT105	P40063	208 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	ZDS2	P54786	942 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	RRN5	Q02983	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	ARV1	Q06541	321 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	GRC3	Q07845	632 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	RDR1	Q08904	546 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	AAC3	P18238	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	GLN3	P18494	730 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	MEI5	P32489	222 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	PMT1	P33775	817 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	POP7	P38291	140 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	PES4	P39684	611 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	SYG1	P40528	902 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REX4	YOL080C	VTC2	P43585	828 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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