RNA–Protein interactions for RNA: YJL028W

YJL028W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YJL028W, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL028W	YJL028W	MBB1	P39534	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	URB2	P47108	1174 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	IRC10	Q08118	586 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SPS4	P09937	338 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SNF3	P10870	884 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	URA4	P20051	364 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SPO11	P23179	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SHP1	P34223	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	VPS41	P38959	992 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	YIL060W	P40519	144 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	SNG1	P46950	547 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	ECM27	P47144	725 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
YJL028W	YJL028W	TOF1	P53840	1238 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	TPO3	Q06451	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	THP1	Q08231	455 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	RAV1	P47104	1357 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YJL028W	YJL028W	CLN1	P20437	546 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	MSP1	P28737	362 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ARA1	P38115	344 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SIF2	P38262	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YHR210C	P38893	341 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	IRC24	P40580	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	HXT9	P40885	567 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YJL132W	P47014	750 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	TAX4	P47030	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	MDE1	P47095	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	DUG3	P53871	357 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YLR456W	Q06199	204 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	PFA4	Q12006	378 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SPO7	P18410	259 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ADY2	P25613	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	BRF1	P29056	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SMI1	P32566	505 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	UIP5	P36137	443 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ROT2	P38138	954 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	FET5	P43561	622 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	PKP2	P53170	491 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SEC5	P89102	971 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SWF1	Q04629	336 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	VAM3	Q12241	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	RHO2	P06781	192 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	DAP2	P18962	818 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	HIR2	P32480	875 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	HOT13	P36078	116 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	DAD2	P36162	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	BNA4	P38169	460 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	YSW1	P38280	609 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	IRC7	P43623	340 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	TOM22	P49334	152 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	BUD32	P53323	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	AEP3	Q12089	606 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
YJL028W	YJL028W	RRD2	Q12461	358 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	STF1	P01098	86 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	RIP1	P08067	215 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	CNA1	P23287	553 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	GEX1	P25596	615 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	MSN2	P33748	704 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	STV1	P37296	890 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ATF1	P40353	525 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	NAS2	P40555	220 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	GPI8	P49018	411 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	UBP8	P50102	471 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	ALT2	P52892	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	MLC1	P53141	149 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YJL028W	YJL028W	PPM1	Q04081	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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