RNA–Protein interactions for RNA: YJL013C

MAD3, Transcript of Subunit of spindle-assembly checkpoint complex, yeast

Gene MAD3, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAD3	YJL013C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	YMR130W	Q04223	302 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ATG26	Q06321	1198 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	COR1	P07256	457 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SPO7	P18410	259 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	OAR1	P35731	278 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MOH1	P38191	138 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SIF2	P38262	535 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	APD1	P38281	316 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	WSS1	P38838	269 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SER3	P40054	469 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	YJL132W	P47014	750 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	DUG3	P53871	357 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SUT2	Q12286	268 aa		5	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	RAV1	P47104	1357 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	RHO2	P06781	192 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	CBP1	P07252	654 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	CLN1	P20437	546 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SHP1	P34223	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PPM1	Q04081	328 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	REX3	Q12090	404 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MED2	Q12124	431 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	NUP1	P20676	1076 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	GYP6	P32806	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MMS4	P38257	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ARN1	P38731	627 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SNG1	P46950	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MDE1	P47095	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MLC1	P53141	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ASI1	P54074	624 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	FMP30	Q02883	468 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PIG1	Q06216	648 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	THP1	Q08231	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	VAM3	Q12241	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SNF3	P10870	884 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SPO11	P23179	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ROT2	P38138	954 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ARP1	P38696	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	UBA4	P38820	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	MEP1	P40260	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	CTF4	Q01454	927 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
MAD3	YJL013C	HSP42	Q12329	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	HIR2	P32480	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	YSW1	P38280	609 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PAC2	P39937	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	FET5	P43561	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	UBP8	P50102	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	SLG1	P54867	378 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	ADA2	Q02336	434 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	DCS1	Q06151	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	TPO3	Q06451	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	BSP1	Q06604	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
MAD3	YJL013C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MAD3	YJL013C	STV1	P37296	890 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	VHC1	P38329	1120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ECM27	P47144	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ALT2	P52892	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	SWF1	Q04629	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
MAD3	YJL013C	RPB8	P20436	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YEL043W	P32618	956 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	BNA4	P38169	460 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	RRF1	P38771	230 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YHR210C	P38893	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	FAD1	P38913	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	YIL060W	P40519	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	EPL1	P43572	832 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MAD3	YJL013C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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