RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	PEX25	Q02969	394 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SNO4	Q04902	237 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	HSP32	Q08992	237 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	MET17	P06106	444 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	IFA38	P38286	347 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.86	□□□□□ -1.79	not detected
NEM1	YHR004C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SDT1	P53078	280 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	EOS1	P53938	366 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	THI20	Q08224	551 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	TMA16	Q08687	178 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	RCN2	Q12044	265 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	AYT1	Q12226	474 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	YLR302C	O13544	120 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	TPK1	P06244	397 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	REC107	P21651	314 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ROX1	P25042	368 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	DPH2	P32461	534 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	MSN2	P33748	704 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ECM15	P35195	104 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	YJL055W	P47044	245 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	JJJ1	P53863	590 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	RTN2	Q12443	393 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SNF3	P10870	884 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	ARP1	P38696	384 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	PCL7	P40186	285 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	SSU1	P41930	458 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	HST1	P53685	503 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	APJ1	P53940	528 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	NUS1	Q12063	375 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	CEX1	Q12453	761 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	PCD1	Q12524	340 aa		3.84	□□□□□ -1.79
NEM1	YHR004C	PMR1	P13586	950 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CLB3	P24870	427 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	PUP2	P32379	260 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	FLC2	P39719	783 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SPO22	P40511	975 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	VPS75	P53853	264 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ADA2	Q02336	434 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CTI6	Q08923	506 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	NMD4	Q12129	218 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SKS1	Q12505	502 aa		3.83	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ADK2	P26364	225 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	GPI10	P30777	616 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SMI1	P32566	505 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	UIP5	P36137	443 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SIP4	P46954	829 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	not detected
NEM1	YHR004C	OAZ1	Q02803	292 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YMR160W	Q03823	816 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	YDR131C	Q03899	556 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	GYL1	Q04322	720 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RCO1	Q04779	684 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TFC6	Q06339	672 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	REX3	Q12090	404 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	COX17	Q12287	69 aa		3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	CAB3	P36076	571 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	ROT2	P38138	954 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RTT105	P40063	208 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	COG1	P53079	417 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	RIM20	Q12033	661 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	NFI1	Q12216	726 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8
NEM1	YHR004C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.81	□□□□□ -1.8

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