RNA–Protein interactions for RNA: YBR279W

PAF1, Transcript of Component of the Paf1p complex involved in transcription elongation, yeast

Gene PAF1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAF1	YBR279W	TWF1	P53250	332 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	THI20	Q08224	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	CKA1	P15790	372 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	ECM15	P35195	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YJL070C	P40361	888 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	GUF1	P46943	645 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	ATG29	Q12092	213 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	CDC23	P16522	626 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	EXO70	P19658	623 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	GCS1	P35197	352 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	CMC1	P36064	111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	BNA4	P38169	460 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	STB2	P46679	850 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	COQ9	Q05779	260 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	NRT1	Q08485	598 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
PAF1	YBR279W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YEL057C	P39983	233 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	SCS3	P53012	380 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	BUD32	P53323	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	CRZ1	P53968	678 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	APE1	P14904	514 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	IKS1	P47042	667 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	SPC19	Q03954	165 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	PDS5	Q04264	1277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	IVY1	Q04934	453 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	SFI1	Q12369	946 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	RAV1	P47104	1357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YML133C	Q03099	1374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	RED1	P14291	827 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	DUG2	P38149	878 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	YER130C	P39959	443 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	MET18	P40469	1032 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PAF1	YBR279W	COR1	P07256	457 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	PMS1	P14242	873 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	YCR007C	P25354	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	YUR1	P26725	428 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	UTR4	P32626	227 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	CBP4	P37267	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MBB1	P39534	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MEP2	P41948	499 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	HXT14	P42833	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	URB2	P47108	1174 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	JJJ1	P53863	590 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RBA50	Q04418	439 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MET17	P06106	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	ROX1	P25042	368 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	GPI10	P30777	616 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SEC66	P33754	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	AIM22	P47051	409 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	GPI1	P53306	609 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	TAF11	Q04226	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	VPS74	Q06385	345 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	DAP1	Q12091	152 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	TIP41	Q12199	356 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SCM3	Q12334	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	PTR2	P32901	601 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	PMT1	P33775	817 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SMF1	P38925	575 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	POP1	P41812	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	ELP2	P42935	788 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
PAF1	YBR279W	YGL260W	P53056	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SLD5	Q03406	294 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	NDD1	Q08887	554 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SUC2	P00724	532 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	ELO2	P25358	347 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	IRC15	Q02733	499 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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