RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	UGA4	P32837	571 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PTM1	P32857	523 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YKR075C	P36155	307 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MRPL3	P36516	390 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MRPL7	P36519	292 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SIF2	P38262	535 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	EXO5	P38289	585 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	POP7	P38291	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MLH1	P38920	769 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GIP4	P39732	760 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PZF1	P39933	429 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SER2	P42941	309 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	CPR7	P47103	393 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	PPT1	P53043	513 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SIW14	P53965	281 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MFB1	Q04922	465 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	GMC2	Q06201	188 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	UBX5	Q06682	500 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	TCO89	Q08921	799 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ULA1	Q12059	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RAD7	P06779	565 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MSS18	P08593	268 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BAR1	P12630	587 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FPS1	P23900	669 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YCR101C	P25607	182 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MKS1	P34072	584 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LST4	P34239	828 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SDS22	P36047	338 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SOH1	P38633	127 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MSR1	P38714	643 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	ORC6	P38826	435 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YJL206C	P39529	758 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RPE1	P46969	238 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YML037C	Q03703	340 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	SKM1	Q12469	655 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CLF1	YLR117C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ARG81	P05085	880 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CDC23	P16522	626 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MAK31	P23059	88 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PRP28	P23394	588 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SED4	P25365	1065 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TRK2	P28584	889 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RGT1	P32862	1170 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	VPS17	P32913	551 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	FMP23	P38231	175 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PEP8	P40335	379 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YIL054W	P40524	105 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PMT5	P52867	743 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CUL3	P53202	744 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CLD1	P53264	445 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SPC98	P53540	846 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RCF2	P53721	224 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	UFO1	Q04511	668 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	APC4	Q04601	652 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	VPS74	Q06385	345 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SWA2	Q06677	668 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SLD7	Q08457	257 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	AEP3	Q12089	606 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	OSW2	Q12202	724 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SVS1	Q12254	260 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GCN4	P03069	281 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TPK1	P06244	397 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ENA1	P13587	1091 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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