RNA–Protein interactions for RNA: YFL036W

RPO41, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase, yeast

Gene RPO41, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO41	YFL036W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ZAP1	P47043	880 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AIM14	P53109	570 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MPS2	P53159	387 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YGR127W	P53275	312 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SRL4	Q03085	281 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PIR3	Q03180	325 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YMR206W	Q03695	313 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	BSP1	Q06604	576 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GLO4	Q12320	285 aa		2.59	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	AAD3	P25612	363 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ALG3	P38179	458 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SWC4	P53201	476 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YGR012W	P53206	393 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YGR053C	P53234	283 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	IBD2	P53892	351 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	NUP100	Q02629	959 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YML131W	Q03102	365 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	TRS31	Q03337	283 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SEG1	Q04279	960 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ATG17	Q06410	417 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	NSE1	Q07913	336 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	LDB17	Q12342	491 aa		2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	FUS1	P11710	512 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MET8	P15807	274 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CLN1	P20437	546 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	RFC3	P38629	340 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ALG5	P40350	334 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MAD3	P47074	515 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YNR065C	P53751	1116 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	GCN5	Q03330	439 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YKU80	Q04437	629 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	KSS1	P14681	368 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SGF29	P25554	259 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	DCC1	P25559	380 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	PEX34	P25584	144 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ZIP1	P31111	875 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MET22	P32179	357 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SPR1	P32603	445 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MAC1	P35192	417 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CAF4	P36130	643 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YBR071W	P38243	211 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	HSE1	P38753	452 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SHU2	P38957	223 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	EMP65	P40085	556 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YIL001W	P40560	513 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MDM34	P53083	459 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	BUD32	P53323	261 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	HER2	Q03557	464 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CRR1	Q05790	422 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SFH1	Q06168	426 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MSS18	P08593	268 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.58	□□□□□ -2	not detected
RPO41	YFL036W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	GID7	P25569	745 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	STE13	P33894	931 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YHR112C	P38716	378 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YLF2	P38746	405 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	AYR1	P40471	297 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YNL260C	P53846	198 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ASI1	P54074	624 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ARG7	Q04728	441 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	ACM1	Q08981	209 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SFM1	Q12314	213 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	PEX11	Q12462	236 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YKR104W	P0CE69	306 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	PMA2	P19657	947 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	URA4	P20051	364 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CYM1	P32898	989 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	TSC10	P38342	320 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CHS6	P40955	746 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	CLD1	P53264	445 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	UGO1	Q03327	502 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	TPP1	Q03796	238 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	NUS1	Q12063	375 aa		2.58	□□□□□ -2
RPO41	YFL036W	MDY2	Q12285	212 aa		2.58	□□□□□ -2

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