RNA–Protein interactions for RNA: YPL135W

ISU1, Transcript of Conserved protein of the mitochondrial matrix, yeast

Gene ISU1, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ISU1	YPL135W	MRX1	P40050	688 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	BUR6	P40096	142 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MEP1	P40260	492 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	JEM1	P40358	645 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	CDC1	P40986	491 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YFR020W	P43600	232 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	DSD1	P53095	428 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	BTN2	P53286	410 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YNL058C	P53947	316 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YDR131C	Q03899	556 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YDR286C	Q05530	114 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YOL159C	Q08300	171 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	CIR2	Q08822	631 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PGC1	Q08959	321 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PFA4	Q12006	378 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SMC6	Q12749	1114 aa		2.76	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RED1	P14291	827 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	KAR3	P17119	729 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SPE2	P21182	396 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	APN1	P22936	367 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MSS51	P32335	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	BYE1	P36106	594 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MNN2	P38069	597 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ORC5	P50874	479 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PFA5	Q03289	374 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MFB1	Q04922	465 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ARP9	Q05123	467 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	THI7	Q05998	598 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	TCO89	Q08921	799 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SFI1	Q12369	946 aa		2.75	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	CHO1	P08456	276 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YMR085W	P0CF18	432 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MBR1	P23493	339 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ROX1	P25042	368 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PEP3	P27801	918 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	DPH2	P32461	534 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	AFG3	P39925	761 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PHM8	P40025	321 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	IRC7	P43623	340 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ZDS2	P54786	942 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	VPS9	P54787	451 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YLR345W	Q06137	509 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ORM2	Q06144	216 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PDR8	Q06149	701 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YDL144C	Q07589	356 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YLR049C	Q12110	428 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	DNF3	Q12674	1656 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	BCK1	Q01389	1478 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	GAL4	P04386	881 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ARG3	P05150	338 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	GPA1	P08539	472 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PMS1	P14242	873 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ORC2	P32833	620 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YAP3	P38749	330 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RRF1	P38771	230 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	LTP1	P40347	161 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
ISU1	YPL135W	CTK2	P46962	323 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	NMD5	P46970	1048 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MRX6	P48564	524 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	NNF2	P53253	936 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	VPS75	P53853	264 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RSC9	Q03124	581 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YML037C	Q03703	340 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	YMR155W	Q03795	547 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MCH4	Q08268	501 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ATG9	Q12142	997 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	HSP42	Q12329	375 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RTN2	Q12443	393 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	SPE4	Q12455	300 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	TRM3	Q07527	1436 aa		2.73	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	GCN4	P03069	281 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	MET17	P06106	444 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	RAP1	P11938	827 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	VMA16	P23968	213 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	DBF4	P32325	704 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	OCT1	P35999	772 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	PXL1	P36166	706 aa		2.72	□□□□□ -1.97
ISU1	YPL135W	ATF1	P40353	525 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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