RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	MRP4	P32902	394 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	NUP120	P35729	1037 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TVP38	P36164	337 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YMC2	P38087	329 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	FLC2	P39719	783 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SCC4	P40090	624 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	KHA1	P40309	873 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	IRC5	P43610	853 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
PSH1	YOL054W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ECL1	P48235	211 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	NMA2	P53204	395 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YNL146W	P53906	100 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TEP1	P53916	434 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YNL058C	P53947	316 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RPM2	Q02773	1202 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	INP2	Q03824	705 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	GAD1	Q04792	585 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YLR224W	Q05947	369 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CIR2	Q08822	631 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ARP7	Q12406	477 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	KCS1	Q12494	1050 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RTP1	Q12751	981 aa		5.69	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CBP1	P07252	654 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	GPA2	P10823	449 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PUT4	P15380	627 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CDC20	P26309	610 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	DPH2	P32461	534 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RIM2	P38127	377 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CTP1	P38152	299 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YHR033W	P38690	423 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PLB1	P39105	664 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ERP2	P39704	215 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TAF1	P46677	1066 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MRM2	P53123	320 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CUL3	P53202	744 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YGR117C	P53270	476 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	NSE5	Q03718	556 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ECM7	Q06200	448 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ATG17	Q06410	417 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	GET4	Q12125	312 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PCD1	Q12524	340 aa		5.68	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SEC15	P22224	910 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RAD14	P28519	371 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MEI4	P29467	408 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SSH4	P32343	579 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ECM4	P36156	370 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YHR112C	P38716	378 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TRM5	P38793	499 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YEL025C	P39991	1188 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	PEP8	P40335	379 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	FAR3	P46671	204 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TAH11	P47112	604 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TAF4	P50105	388 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	NUP84	P52891	726 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TRS130	Q03660	1102 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	TVP15	Q03860	143 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	HLR1	Q04429	423 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	BCP1	Q06338	283 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	STP4	Q07351	490 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YPR202W	Q08993	238 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	CSR2	Q12734	1121 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	VPS13	Q07878	3144 aa		5.67	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SNT1	P25357	1226 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	SHP1	P34223	423 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	LHS1	P36016	881 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	EXO84	P38261	753 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MAM33	P40513	266 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	POL31	P46957	487 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	ZAP1	P47043	880 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MAD3	P47074	515 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	MND1	P53102	219 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	YDR476C	Q03362	224 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	VPS36	Q06696	566 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	AIM39	Q08223	395 aa		5.66	□□□□□ -1.5
PSH1	YOL054W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.66	□□□□□ -1.5

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