RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	NET1	P47035	1189 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	VPS25	P47142	202 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	VID30	P53076	958 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PKP2	P53170	491 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YGR127W	P53275	312 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	MCP2	Q06567	569 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RLM1	Q12224	676 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	HER1	Q12276	1246 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PUT2	P07275	575 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	CKA1	P15790	372 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ROX1	P25042	368 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PTP1	P25044	335 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	SEF1	P34228	1148 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YKL100C	P34248	587 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	MET18	P40469	1032 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RSM23	Q01163	450 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	IZH1	Q03419	316 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ARP10	Q04549	284 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	VPS38	Q05919	439 aa		4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	GAL80	P04387	435 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ARG81	P05085	880 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	SNF3	P10870	884 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RED1	P14291	827 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	BOS1	P25385	244 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	SCO2	P38072	301 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	UBA4	P38820	440 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	VRG4	P40107	337 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ALG5	P40350	334 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PTR3	P43606	678 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PET130	P47065	347 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	POS5	Q06892	414 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ATX2	Q12067	313 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	AVL9	Q12500	764 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RPB8	P20436	146 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	GPI10	P30777	616 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ERG3	P32353	365 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	ICS2	P38284	255 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	PHO90	P39535	881 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	JJJ1	P53863	590 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	BOP3	P53958	396 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	COQ9	Q05779	260 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	GSH2	Q08220	491 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	SCM3	Q12334	223 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	GRX6	Q12438	231 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RPC17	YJL011C	FOB1	O13329	566 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	YPR089W	O13585	888 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	CBP1	P07252	654 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	ELO2	P25358	347 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	PRD1	P25375	712 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	EKI1	Q03764	534 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	RTN2	Q12443	393 aa		4.4	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	CIN4	P39110	191 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	PCI8	P40512	444 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	AIM22	P47051	409 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	SOL4	P53315	255 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	FIN1	Q03898	291 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	RDR1	Q08904	546 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	ASK1	P35734	292 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	CST26	P38226	397 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	MDV1	P47025	714 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	YNL234W	P53857	426 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	ESBP6	P53918	673 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	NUP100	Q02629	959 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	ECI1	Q05871	280 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.38	□□□□□ -1.71	not detected
RPC17	YJL011C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.38	□□□□□ -1.71	not detected
RPC17	YJL011C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	MRE11	P32829	692 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	NPL6	P32832	435 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	PDR3	P33200	976 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	RKM3	P38222	552 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	MUM2	P38236	366 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	SMF1	P38925	575 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RPC17	YJL011C	PCL6	P40038	420 aa		4.37	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.5 ms