RNA–Protein interactions for RNA: YAL067C

SEO1, Transcript of Putative permease, yeast

Gene SEO1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEO1	YAL067C	YJL132W	P47014	750 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	EFM3	P47163	339 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YGR149W	P48236	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MUP1	P50276	574 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	UBC11	P52492	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YNL143C	P53908	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ARP5	P53946	755 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ARG7	Q04728	441 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MSC3	Q05812	728 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	QCR6	P00127	147 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SIR3	P06701	978 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ELO2	P25358	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	CDC20	P26309	610 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YTA12	P40341	825 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	AGX1	P43567	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	DIA3	P52290	468 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	AQR1	P53943	586 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SKO1	Q02100	647 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RRN5	Q02983	363 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MLH3	Q12083	715 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YLR358C	O13565	187 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PHO11	P35842	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MRPL4	P36517	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	CCL1	P37366	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PHO12	P38693	467 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	LNP1	P38878	278 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ELP2	P42935	788 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	TOM22	P49334	152 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YNL144C	P53907	740 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RXT3	Q07458	294 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SIL1	Q08199	421 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	APC5	Q08683	685 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SPO7	P18410	259 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	FUB1	P25659	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YIM1	P28625	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PFF1	P38244	976 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	HSM3	P38348	480 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	UIP3	P39547	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	COS5	P47187	383 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YGL138C	P53122	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YGR266W	P53326	701 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YLR224W	Q05947	369 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	COS7	Q07788	383 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	URA4	P20051	364 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YME1	P32795	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
SEO1	YAL067C	EPL1	P43572	832 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	FAR3	P46671	204 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	NUP84	P52891	726 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	BUD17	P53727	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	MFM1	Q02783	413 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	UBP16	Q02863	499 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	GCN5	Q03330	439 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	VPS20	Q04272	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	IRC13	Q08630	104 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	INP53	Q12271	1107 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SFG1	Q12507	346 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	CLN1	P20437	546 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ELO1	P39540	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	ECM10	P39987	644 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	PHM8	P40025	321 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	YIP4	P53093	235 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SEO1	YAL067C	SNO2	P53823	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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