RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	IMA1	P53051	589 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ACS1	Q01574	713 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YLR001C	Q07895	862 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SIL1	Q08199	421 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SGT1	Q08446	395 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PUS9	Q12069	462 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YPR063C	Q12160	140 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PET54	P10834	293 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CMK2	P22517	447 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CWH43	P25618	953 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PMT2	P31382	759 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MEI5	P32489	222 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TAF14	P35189	244 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	OAF3	P36023	863 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YKL133C	P36066	463 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MRPL7	P36519	292 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ETR1	P38071	380 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.17	□□□□□ -1.9	not detected
DOA4	YDR069C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YHL017W	P38745	532 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TRM5	P38793	499 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YER130C	P39959	443 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RTS2	P40962	232 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPE1	P46969	238 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YTP1	P53584	459 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ATP25	Q03153	612 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MMT1	Q03218	510 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	IVY1	Q04934	453 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GRS2	Q06817	618 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AEP3	Q12089	606 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AHC1	Q12433	566 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	APM4	Q99186	491 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SFL1	P20134	766 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CLB3	P24870	427 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SPS22	P25380	463 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CDC15	P27636	974 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	STB6	P36085	766 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FUI1	P38196	639 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YHR131C	P38835	850 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SMF1	P38925	575 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YJR061W	P40355	935 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	COS4	P43542	379 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FAR7	P43592	221 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	IRC5	P43610	853 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GLG2	P47011	380 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	COS5	P47187	383 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MNT2	P53059	558 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MET13	P53128	600 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	COS1	P53822	381 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	BNA7	Q04066	261 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YPR071W	Q12346	211 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CDC23	P16522	626 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HXT1	P32465	570 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GSH1	P32477	678 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GRX4	P32642	244 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	APM3	P38153	483 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YGL108C	P53139	140 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ZRG17	P53735	605 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NGL3	Q03210	505 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NHP10	Q03435	203 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TAF9	Q05027	157 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	BUR2	Q05949	395 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VTA1	Q06263	330 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YFT2	Q06676	274 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ESC8	Q08119	714 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MUM3	Q08750	479 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YPL191C	Q08930	360 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YLL058W	Q12198	575 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RRI2	Q12348	645 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HMS1	Q12398	434 aa		3.17	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		3.16	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		3.16	□□□□□ -1.9

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