RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W RNR4P49723 345 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W AQR1P53943 586 aa11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W RMI1Q02685 241 aa11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SPO20Q04359 397 aa11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ENT4Q07872 247 aa11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W UPC2Q12151 913 aa11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YPL247CQ12523 523 aa11.08□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W HEM2P05373 342 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W NMT1P14743 455 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W EPT1P22140 391 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W TFC3P34111 1160 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ARP1P38696 384 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YHR078WP38799 552 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W NNF1P47149 201 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W NUP84P52891 726 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W GOT1Q03554 138 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W RCO1Q04779 684 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W GTT2Q12390 233 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W CCH1P50077 2039 aa11.07□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SKT5P34226 696 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W THI80P35202 319 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SPT23P35210 1082 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W DSF2P38213 736 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W DBP8P38719 431 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ERP5P38819 212 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W BZZ1P38822 633 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W UTP9P38882 575 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YHB1P39676 399 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W EFM5P53200 248 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W LSM3P57743 89 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data11.06□□□□□ -0.64 RIP-Chip
RNQ1YCL028W YMR102CQ03177 834 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W GNT1Q12096 491 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YOR012WQ12351 137 aa11.06□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W CPA1P07258 411 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ART10P18634 518 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W TOA1P32773 286 aa11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W TIP20P33891 701 aa11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data11.05□□□□□ -0.64not detected
RNQ1YCL028W VMA13P41807 478 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YRB1P41920 201 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YNR014WP53719 212 aa11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SMA1Q02651 245 aa11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W HDA3Q06623 655 aa11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ATG10Q07879 167 aa11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W MEX67Q99257 599 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SUC2P00724 532 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W EXO70P19658 623 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W LRG1P35688 1017 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W VRP1P37370 817 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W CYC2P38909 366 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W COA1P40452 197 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W IBD2P53892 351 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W CCE1Q03702 353 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W RSC3Q06639 885 aa11.04□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ARG1P22768 420 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W MVD1P32377 396 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W NUP120P35729 1037 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W CTP1P38152 299 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W IML3P38265 245 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W TAE1P38340 232 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W RFC3P38629 340 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SSN3P39073 555 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W MEP1P40260 492 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W FAA4P47912 694 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W SLM2P53955 656 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W TRM12Q04235 462 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W EMI1Q04406 187 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W OPI10Q08202 246 aa11.03□□□□□ -0.64
RNQ1YCL028W YKR104WP0CE69 306 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GMH1P36125 273 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RIM11P38615 370 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YHR045WP38775 560 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W DMA1P38823 416 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W PIK1P39104 1066 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W DHH1P39517 506 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YFR018CP43599 363 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W NBP35P52920 328 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W YGL108CP53139 140 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W UBP2Q01476 1272 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W FMN1Q03778 218 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W SPC24Q04477 213 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RIF2Q06208 395 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W VAM6Q07468 1049 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W IOC2Q12072 812 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W Q0182Q9ZZW1 134 aa11.02□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HTA1P04911 132 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W HTA2P04912 132 aa11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W RFA2P26754 273 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W FMO1P38866 432 aa11.01□□□□□ -0.65
RNQ1YCL028W GAT1P43574 510 aa11.01□□□□□ -0.65
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