RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	SNT1	P25357	1226 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GID7	P25569	745 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	AAD3	P25612	363 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SGE1	P33335	543 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GMH1	P36125	273 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CTP1	P38152	299 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	EXO84	P38261	753 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FLO5	P38894	1075 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	VPS8	P39702	1274 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YIL152W	P40455	235 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ALG2	P43636	503 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	POL31	P46957	487 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SSY5	P47002	699 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PCL10	P53124	433 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TOF1	P53840	1238 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	INN1	P53901	409 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TRS130	Q03660	1102 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YDR109C	Q04585	715 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GRX8	Q05926	109 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RAX1	Q08760	435 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RKM5	Q12367	367 aa		0.51	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CCW14	O13547	238 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CDC9	P04819	755 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MRP7	P12687	371 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	URA4	P20051	364 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HXT4	P32467	576 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PXA2	P34230	853 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MMS21	P38632	267 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YHR054C	P38780	354 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	VFA1	P40080	203 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	FMS1	P50264	508 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ALF1	P53904	254 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	UBX4	P54730	416 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PRM15	Q03262	622 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TRS23	Q03784	219 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YET2	Q04210	160 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MDM30	Q05930	598 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MLH2	Q07980	695 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	GLE1	Q12315	538 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RRI2	Q12348	645 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TRA1	P38811	3744 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SAL1	D6W196	494 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RAD3	P06839	778 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CIT2	P08679	460 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YFL068W	P0CX99	160 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	IME1	P21190	360 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MSH1	P25846	959 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SIN4	P32259	974 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	DSS4	P32601	143 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	BEM3	P32873	1128 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SHP1	P34223	423 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MRPL37	P36532	105 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ECM13	P38195	257 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YBR259W	P38338	688 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SIP3	P38717	1229 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YHL044W	P38727	235 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YER188W	P40103	239 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SPG5	P42933	373 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	MDE1	P47095	244 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CTF18	P49956	741 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ASE1	P50275	885 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	ORC4	P54791	529 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COQ9	Q05779	260 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YDL073W	Q07454	984 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	RSA1	Q08932	381 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	REX3	Q12090	404 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	PSY3	Q12318	242 aa		0.5	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	COX1	P00401	534 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	YKR104W	P0CE69	306 aa		0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
AI1	Q0050	TOP3	P13099	656 aa		0.49	□□□□□ -2.33

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