RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	STP3	Q05937	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DCI1	Q08558	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	NUS1	Q12063	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SRB8	P25648	1427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	GAL7	P08431	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PUT4	P15380	627 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SPS22	P25380	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	AFG1	P32317	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	HMX1	P32339	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SFA1	P32771	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PMT1	P33775	817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	GPT2	P36148	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MAL33	P38157	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	BUD14	P27637	709 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	STB5	P38699	743 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YHL017W	P38745	532 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TED1	P40533	473 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ASE1	P50275	885 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DSE4	P53753	1117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PPN1	Q04119	674 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	VPS20	Q04272	221 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YOR223W	Q12015	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SEC66	P33754	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	CMC1	P36064	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	BIT61	P47041	543 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LSC2	P53312	427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YNL050C	P53952	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	AVL9	Q12500	764 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MMS1	Q06211	1407 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TPK2	P06245	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
TYW1	YPL207W	RRM3	P38766	723 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	RIP-Chip
TYW1	YPL207W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SER3	P40054	469 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YNL195C	P40168	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SMC3	P47037	1230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YML037C	Q03703	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TPP1	Q03796	238 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	VPS38	Q05919	439 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DOA4	P32571	926 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YME1	P32795	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ASH1	P34233	588 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	ELP2	P42935	788 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	FMS1	P50264	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	YNL143C	P53908	130 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	AQR1	P53943	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	INP2	Q03824	705 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SLP1	Q12232	587 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	SVS1	Q12254	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TYW1	YPL207W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	SAM35	P14693	329 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	SAC7	P17121	654 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	WSS1	P38838	269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	FTR1	P40088	404 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	YLR413W	Q06689	675 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	BNR1	P40450	1375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	COQ4	O13525	335 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	VPS33	P20795	691 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	MRE11	P32829	692 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	SLM4	P38247	162 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	EHT1	P38295	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	SFB3	P38810	929 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TYW1	YPL207W	CTF8	P38877	133 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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