RNA–Protein interactions for RNA: YOL013C

HRD1, Transcript of Ubiquitin-protein ligase, yeastyeast

Gene HRD1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1YOL013C OSW5P40219 148 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MET28P40573 187 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C VMA13P41807 478 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CUL3P53202 744 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C IMO32P53219 342 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MUB1Q03162 620 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C ROY1Q04847 553 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YLR456WQ06199 204 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YDL086WQ07505 273 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C BUD7Q08754 746 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C RIM20Q12033 661 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YNL162W-AQ3E7A8 72 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YOR019WQ99248 730 aa3.46□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C TUF1P02992 437 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SUI2P20459 304 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CLB3P24870 427 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C NTH1P32356 751 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C GYP6P32806 458 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C UBP11P36026 717 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C FLO10P36170 1169 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CCT6P39079 546 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SLZ1P40167 298 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YIL161WP40449 235 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MAF1P41910 395 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MPS3P47069 682 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SPC98P53540 846 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SNF12P53628 566 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C EOS1P53938 366 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PPN1Q04119 674 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C RPN5Q12250 445 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SKS1Q12505 502 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C AFI1Q99222 893 aa3.45□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C HSL1P34244 1518 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SWR1Q05471 1514 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YMR084WA2P2R3 262 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C RPS9BP05755 195 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PRE8P23639 250 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C APL3P38065 1025 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C THI2P38141 450 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CTP1P38152 299 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C KSP1P38691 1029 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PAC2P39937 518 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YIL077CP40508 320 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data3.44□□□□□ -1.86not detected
HRD1YOL013C RFX1P48743 811 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C COS12P53053 380 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SPO1P53541 631 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C HST1P53685 503 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C ERV25P54837 211 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YML037CQ03703 340 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C HOF1Q05080 669 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PHO92Q06390 306 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YFT2Q06676 274 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SWA2Q06677 668 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YEH1Q07804 573 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YPT6Q99260 215 aa3.44□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CTT1P06115 562 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C DAP2P18962 818 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MSP1P28737 362 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C PCH2P38126 564 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C COS111P38308 924 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C BUD16P39988 312 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MRX1P40050 688 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MRK1P50873 501 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C ADA2Q02336 434 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SPH1Q06160 661 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YDL073WQ07454 984 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YJR112W-AQ3E743 109 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C TPK2P06245 380 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CPR2P23285 205 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C URK1P27515 501 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SUR1P33300 382 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C CST26P38226 397 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C VID24P38263 362 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YSW1P38280 609 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YHR054CP38780 354 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C ASE1P50275 885 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C EFR3Q03653 782 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C RNH1Q04740 348 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MRN1Q08925 612 aaKnown RBP RIP-Chip data3.43□□□□□ -1.86not detected
HRD1YOL013C YPL272CQ08984 517 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C APL4Q12028 832 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C NUS1Q12063 375 aa3.43□□□□□ -1.86
HRD1YOL013C MDY2Q12285 212 aa3.43□□□□□ -1.86
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