RNA–Protein interactions for RNA: YHR170W

NMD3, Transcript of Protein involved in nuclear export of the large ribosomal subunit, yeast

Gene NMD3, Length 1,557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NMD3	YHR170W	DDC1	Q08949	612 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	TAO3	P40468	2376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	ENA1	P13587	1091 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	YCR015C	P25616	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	MEI4	P29467	408 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	DAL3	P32459	195 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	EMC3	P36039	253 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	APN2	P38207	520 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	PCA1	P38360	1216 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	OPT1	P40897	799 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	CDC1	P40986	491 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	MAF1	P41910	395 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	IML2	P47031	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	SPC19	Q03954	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	ERV41	Q04651	352 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	PRM6	Q04705	352 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	RRD2	Q12461	358 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	PRC1	P00729	532 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
NMD3	YHR170W	CDC9	P04819	755 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	HAP2	P06774	265 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	HSF1	P10961	833 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	SLY1	P22213	666 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	MGT1	P26188	188 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	RPD3	P32561	433 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	TKL2	P33315	681 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	STE13	P33894	931 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	DUG2	P38149	878 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	YBP1	P38315	674 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	CIN4	P39110	191 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	TAF9	Q05027	157 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	THI7	Q05998	598 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	ADY3	Q07732	790 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	TPO1	Q07824	586 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	THI20	Q08224	551 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	GPM2	Q12008	311 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	HRT3	Q12347	344 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	VPS5	Q92331	675 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NMD3	YHR170W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SPO16	P17122	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RNQ1	P25367	405 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	MRPL7	P36519	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YBR053C	P38235	358 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YHR202W	P38887	602 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	ARG2	P40360	574 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	INA22	P40576	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RRT5	P43607	289 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	NIT2	P47016	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YJR079W	P47126	109 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YNL144C	P53907	740 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	GCN5	Q03330	439 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SKY1	Q03656	742 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	USA1	Q03714	838 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	STE23	Q06010	1027 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	THI21	Q08975	551 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	NBP2	Q12163	236 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	APM4	Q99186	491 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	POL3	P15436	1097 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YCL002C	P25565	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	PCL2	P25693	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	KDX1	P36005	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	POA1	P38218	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	POP4	P38336	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	CKB2	P38930	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	LYS9	P38999	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	YIR016W	P40572	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	URB2	P47108	1174 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
NMD3	YHR170W	KTR6	P54070	446 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NMD3	YHR170W	FMP30	Q02883	468 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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