RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	REG1	Q00816	1014 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ECM30	Q06673	1274 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	VAM6	Q07468	1049 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	FRE5	Q08908	694 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	HIP1	P06775	603 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ABF1	P14164	731 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ERG4	P25340	473 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	UBP11	P36026	717 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ELF1	P36053	145 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TAO3	P40468	2376 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	SIP4	P46954	829 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TAM41	P53230	385 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TIM10	P87108	93 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YKU80	Q04437	629 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YPR117W	Q06116	2489 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	CDA2	Q06703	312 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YDL086W	Q07505	273 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TMA16	Q08687	178 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	NUS1	Q12063	375 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	MRP20	P32387	263 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TFC3	P34111	1160 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	MRPL7	P36519	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YBR225W	P38321	900 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	LNP1	P38878	278 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	GAA1	P39012	614 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	FMP52	P40008	231 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	IRC6	P43615	237 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YGL138C	P53122	345 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	MFM1	Q02783	413 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	CSM3	Q04659	317 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	RCO1	Q04779	684 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	MFB1	Q04922	465 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	MLH3	Q12083	715 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	SCM3	Q12334	223 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	TRM13	Q12383	476 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CIA2	YHR122W	RIF1	P29539	1916 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SIR3	P06701	978 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	ERG8	P24521	451 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SGF29	P25554	259 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YCR061W	P25639	631 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YBL029W	P38201	376 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	OPY1	P38271	328 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	5.08	□□□□□ -1.6	not detected
CIA2	YHR122W	SAD1	P43589	448 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	FHN1	P53279	174 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	TAF11	Q04226	346 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	VPS20	Q04272	221 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	STP3	Q05937	343 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	AIM39	Q08223	395 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	USV1	Q12132	391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	GCN4	P03069	281 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	ALG7	P07286	448 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SPO16	P17122	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	BLI1	P35727	113 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	TDP1	P38319	544 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YHL017W	P38745	532 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	PSD1	P39006	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	THI6	P41835	540 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YFL040W	P43562	540 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	BUL1	P48524	976 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	AZR1	P50080	613 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YGR151C	P53287	111 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	DIP5	P53388	608 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YSA1	Q01976	231 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	RNT1	Q02555	471 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	ARP9	Q05123	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	YLH47	Q06493	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	ENT4	Q07872	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CIA2	YHR122W	SNA3	P14359	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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